Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SALL3Q9BXA9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SALL3Q9BXA9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SALL3Q9BXA9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SALL3Q9BXA9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SALL3Q9BXA9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SALL3Q9BXA9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SALL3Q9BXA9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SALL3Q9BXA9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
SALL3Q9BXA9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SALL3Q9BXA9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SALL3Q9BXA9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
SALL3Q9BXA9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SALL3Q9BXA9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SALL3Q9BXA9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SALL3Q9BXA9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SALL3Q9BXA9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SALL3Q9BXA9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SALL3Q9BXA9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SALL3Q9BXA9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SALL3Q9BXA9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SALL3Q9BXA9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SALL3Q9BXA9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SALL3Q9BXA9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SALL3Q9BXA9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SALL3Q9BXA9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SALL3Q9BXA9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SALL3Q9BXA9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SALL3Q9BXA9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SALL3Q9BXA9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SALL3Q9BXA9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SALL3Q9BXA9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SALL3Q9BXA9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SALL3Q9BXA9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SALL3Q9BXA9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SALL3Q9BXA9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SALL3Q9BXA9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SALL3Q9BXA9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SALL3Q9BXA9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SALL3Q9BXA9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SALL3Q9BXA9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SALL3Q9BXA9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SALL3Q9BXA9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SALL3Q9BXA9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SALL3Q9BXA9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SALL3Q9BXA9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SALL3Q9BXA9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SALL3Q9BXA9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SALL3Q9BXA9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SALL3Q9BXA9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SALL3Q9BXA9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SALL3Q9BXA9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SALL3Q9BXA9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SALL3Q9BXA9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SALL3Q9BXA9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SALL3Q9BXA9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SALL3Q9BXA9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SALL3Q9BXA9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SALL3Q9BXA9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SALL3Q9BXA9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SALL3Q9BXA9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SALL3Q9BXA9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SALL3Q9BXA9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SALL3Q9BXA9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SALL3Q9BXA9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SALL3Q9BXA9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SALL3Q9BXA9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SALL3Q9BXA9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SALL3Q9BXA9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SALL3Q9BXA9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SALL3Q9BXA9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SALL3Q9BXA9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SALL3Q9BXA9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SALL3Q9BXA9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SALL3Q9BXA9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SALL3Q9BXA9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SALL3Q9BXA9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
SALL3Q9BXA9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SALL3Q9BXA9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SALL3Q9BXA9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SALL3Q9BXA9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SALL3Q9BXA9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SALL3Q9BXA9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SALL3Q9BXA9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SALL3Q9BXA9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SALL3Q9BXA9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SALL3Q9BXA9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SALL3Q9BXA9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SALL3Q9BXA9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SALL3Q9BXA9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SALL3Q9BXA9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SALL3Q9BXA9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SALL3Q9BXA9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SALL3Q9BXA9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SALL3Q9BXA9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SALL3Q9BXA9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SALL3Q9BXA9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SALL3Q9BXA9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SALL3Q9BXA9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
SALL3Q9BXA9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms