Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX79

STRA6, Stimulated by retinoic acid gene 6 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRA6Q9BX79 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
STRA6Q9BX79 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
STRA6Q9BX79 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
STRA6Q9BX79 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
STRA6Q9BX79 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
STRA6Q9BX79 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
STRA6Q9BX79 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
STRA6Q9BX79 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
STRA6Q9BX79 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
STRA6Q9BX79 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
STRA6Q9BX79 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
STRA6Q9BX79 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
STRA6Q9BX79 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
STRA6Q9BX79 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
STRA6Q9BX79 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
STRA6Q9BX79 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
STRA6Q9BX79 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
STRA6Q9BX79 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
STRA6Q9BX79 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
STRA6Q9BX79 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
STRA6Q9BX79 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
STRA6Q9BX79 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
STRA6Q9BX79 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
STRA6Q9BX79 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
STRA6Q9BX79 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
STRA6Q9BX79 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
STRA6Q9BX79 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
STRA6Q9BX79 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
STRA6Q9BX79 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
STRA6Q9BX79 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
STRA6Q9BX79 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
STRA6Q9BX79 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
STRA6Q9BX79 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
STRA6Q9BX79 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
STRA6Q9BX79 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
STRA6Q9BX79 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
STRA6Q9BX79 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
STRA6Q9BX79 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
STRA6Q9BX79 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
STRA6Q9BX79 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
STRA6Q9BX79 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
STRA6Q9BX79 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
STRA6Q9BX79 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
STRA6Q9BX79 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
STRA6Q9BX79 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
STRA6Q9BX79 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
STRA6Q9BX79 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
STRA6Q9BX79 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
STRA6Q9BX79 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
STRA6Q9BX79 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
STRA6Q9BX79 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
STRA6Q9BX79 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
STRA6Q9BX79 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
STRA6Q9BX79 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
STRA6Q9BX79 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
STRA6Q9BX79 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
STRA6Q9BX79 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
STRA6Q9BX79 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
STRA6Q9BX79 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
STRA6Q9BX79 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
STRA6Q9BX79 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
STRA6Q9BX79 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
STRA6Q9BX79 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
STRA6Q9BX79 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
STRA6Q9BX79 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
STRA6Q9BX79 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
STRA6Q9BX79 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
STRA6Q9BX79 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
STRA6Q9BX79 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
STRA6Q9BX79 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
STRA6Q9BX79 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
STRA6Q9BX79 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
STRA6Q9BX79 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
STRA6Q9BX79 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
STRA6Q9BX79 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
STRA6Q9BX79 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
STRA6Q9BX79 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
STRA6Q9BX79 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
STRA6Q9BX79 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
STRA6Q9BX79 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
STRA6Q9BX79 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
STRA6Q9BX79 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
STRA6Q9BX79 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
STRA6Q9BX79 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
STRA6Q9BX79 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
STRA6Q9BX79 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
STRA6Q9BX79 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
STRA6Q9BX79 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
STRA6Q9BX79 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
STRA6Q9BX79 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
STRA6Q9BX79 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
STRA6Q9BX79 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
STRA6Q9BX79 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
STRA6Q9BX79 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
STRA6Q9BX79 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
STRA6Q9BX79 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
STRA6Q9BX79 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
STRA6Q9BX79 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
STRA6Q9BX79 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
STRA6Q9BX79 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.2 ms