Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIGD2AQ9BW72 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HIGD2AQ9BW72 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIGD2AQ9BW72 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIGD2AQ9BW72 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIGD2AQ9BW72 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIGD2AQ9BW72 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIGD2AQ9BW72 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HIGD2AQ9BW72 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIGD2AQ9BW72 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIGD2AQ9BW72 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIGD2AQ9BW72 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIGD2AQ9BW72 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
HIGD2AQ9BW72 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIGD2AQ9BW72 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIGD2AQ9BW72 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIGD2AQ9BW72 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HIGD2AQ9BW72 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HIGD2AQ9BW72 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HIGD2AQ9BW72 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIGD2AQ9BW72 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HIGD2AQ9BW72 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
HIGD2AQ9BW72 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HIGD2AQ9BW72 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HIGD2AQ9BW72 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HIGD2AQ9BW72 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HIGD2AQ9BW72 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HIGD2AQ9BW72 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HIGD2AQ9BW72 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HIGD2AQ9BW72 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIGD2AQ9BW72 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HIGD2AQ9BW72 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HIGD2AQ9BW72 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HIGD2AQ9BW72 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIGD2AQ9BW72 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HIGD2AQ9BW72 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HIGD2AQ9BW72 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HIGD2AQ9BW72 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HIGD2AQ9BW72 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HIGD2AQ9BW72 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIGD2AQ9BW72 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HIGD2AQ9BW72 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIGD2AQ9BW72 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HIGD2AQ9BW72 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIGD2AQ9BW72 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIGD2AQ9BW72 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIGD2AQ9BW72 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
HIGD2AQ9BW72 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HIGD2AQ9BW72 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIGD2AQ9BW72 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIGD2AQ9BW72 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HIGD2AQ9BW72 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIGD2AQ9BW72 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIGD2AQ9BW72 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HIGD2AQ9BW72 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HIGD2AQ9BW72 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HIGD2AQ9BW72 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HIGD2AQ9BW72 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HIGD2AQ9BW72 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HIGD2AQ9BW72 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HIGD2AQ9BW72 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HIGD2AQ9BW72 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HIGD2AQ9BW72 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HIGD2AQ9BW72 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HIGD2AQ9BW72 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HIGD2AQ9BW72 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HIGD2AQ9BW72 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
HIGD2AQ9BW72 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIGD2AQ9BW72 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIGD2AQ9BW72 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIGD2AQ9BW72 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIGD2AQ9BW72 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIGD2AQ9BW72 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIGD2AQ9BW72 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIGD2AQ9BW72 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIGD2AQ9BW72 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIGD2AQ9BW72 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIGD2AQ9BW72 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIGD2AQ9BW72 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIGD2AQ9BW72 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HIGD2AQ9BW72 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIGD2AQ9BW72 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIGD2AQ9BW72 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HIGD2AQ9BW72 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIGD2AQ9BW72 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIGD2AQ9BW72 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIGD2AQ9BW72 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIGD2AQ9BW72 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIGD2AQ9BW72 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIGD2AQ9BW72 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIGD2AQ9BW72 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIGD2AQ9BW72 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIGD2AQ9BW72 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIGD2AQ9BW72 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIGD2AQ9BW72 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIGD2AQ9BW72 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIGD2AQ9BW72 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIGD2AQ9BW72 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIGD2AQ9BW72 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HIGD2AQ9BW72 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms