Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVV2

FNDC11, Fibronectin type III domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC11Q9BVV2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC11Q9BVV2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC11Q9BVV2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC11Q9BVV2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC11Q9BVV2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC11Q9BVV2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC11Q9BVV2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC11Q9BVV2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC11Q9BVV2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC11Q9BVV2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC11Q9BVV2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC11Q9BVV2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC11Q9BVV2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC11Q9BVV2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC11Q9BVV2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC11Q9BVV2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC11Q9BVV2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC11Q9BVV2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC11Q9BVV2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC11Q9BVV2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC11Q9BVV2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC11Q9BVV2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNDC11Q9BVV2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNDC11Q9BVV2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNDC11Q9BVV2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FNDC11Q9BVV2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FNDC11Q9BVV2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNDC11Q9BVV2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNDC11Q9BVV2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNDC11Q9BVV2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FNDC11Q9BVV2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNDC11Q9BVV2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNDC11Q9BVV2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNDC11Q9BVV2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNDC11Q9BVV2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNDC11Q9BVV2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNDC11Q9BVV2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNDC11Q9BVV2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNDC11Q9BVV2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNDC11Q9BVV2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNDC11Q9BVV2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNDC11Q9BVV2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNDC11Q9BVV2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNDC11Q9BVV2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNDC11Q9BVV2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNDC11Q9BVV2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNDC11Q9BVV2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNDC11Q9BVV2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNDC11Q9BVV2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNDC11Q9BVV2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNDC11Q9BVV2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNDC11Q9BVV2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNDC11Q9BVV2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNDC11Q9BVV2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FNDC11Q9BVV2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FNDC11Q9BVV2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FNDC11Q9BVV2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FNDC11Q9BVV2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FNDC11Q9BVV2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNDC11Q9BVV2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNDC11Q9BVV2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNDC11Q9BVV2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNDC11Q9BVV2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNDC11Q9BVV2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FNDC11Q9BVV2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNDC11Q9BVV2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNDC11Q9BVV2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNDC11Q9BVV2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNDC11Q9BVV2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNDC11Q9BVV2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FNDC11Q9BVV2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FNDC11Q9BVV2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FNDC11Q9BVV2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FNDC11Q9BVV2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FNDC11Q9BVV2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FNDC11Q9BVV2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
FNDC11Q9BVV2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNDC11Q9BVV2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FNDC11Q9BVV2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNDC11Q9BVV2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNDC11Q9BVV2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNDC11Q9BVV2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNDC11Q9BVV2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNDC11Q9BVV2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNDC11Q9BVV2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNDC11Q9BVV2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNDC11Q9BVV2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNDC11Q9BVV2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNDC11Q9BVV2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNDC11Q9BVV2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNDC11Q9BVV2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNDC11Q9BVV2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNDC11Q9BVV2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNDC11Q9BVV2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNDC11Q9BVV2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNDC11Q9BVV2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNDC11Q9BVV2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNDC11Q9BVV2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FNDC11Q9BVV2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FNDC11Q9BVV2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms