Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CRACR2AQ9BSW2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CRACR2AQ9BSW2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CRACR2AQ9BSW2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CRACR2AQ9BSW2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CRACR2AQ9BSW2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CRACR2AQ9BSW2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CRACR2AQ9BSW2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CRACR2AQ9BSW2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CRACR2AQ9BSW2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CRACR2AQ9BSW2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CRACR2AQ9BSW2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CRACR2AQ9BSW2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CRACR2AQ9BSW2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CRACR2AQ9BSW2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CRACR2AQ9BSW2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CRACR2AQ9BSW2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CRACR2AQ9BSW2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CRACR2AQ9BSW2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CRACR2AQ9BSW2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CRACR2AQ9BSW2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CRACR2AQ9BSW2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CRACR2AQ9BSW2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CRACR2AQ9BSW2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CRACR2AQ9BSW2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CRACR2AQ9BSW2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CRACR2AQ9BSW2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CRACR2AQ9BSW2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CRACR2AQ9BSW2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CRACR2AQ9BSW2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CRACR2AQ9BSW2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CRACR2AQ9BSW2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CRACR2AQ9BSW2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CRACR2AQ9BSW2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CRACR2AQ9BSW2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CRACR2AQ9BSW2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CRACR2AQ9BSW2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CRACR2AQ9BSW2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CRACR2AQ9BSW2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CRACR2AQ9BSW2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CRACR2AQ9BSW2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CRACR2AQ9BSW2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CRACR2AQ9BSW2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CRACR2AQ9BSW2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRACR2AQ9BSW2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRACR2AQ9BSW2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CRACR2AQ9BSW2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CRACR2AQ9BSW2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CRACR2AQ9BSW2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRACR2AQ9BSW2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CRACR2AQ9BSW2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CRACR2AQ9BSW2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CRACR2AQ9BSW2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRACR2AQ9BSW2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRACR2AQ9BSW2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CRACR2AQ9BSW2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CRACR2AQ9BSW2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CRACR2AQ9BSW2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CRACR2AQ9BSW2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
CRACR2AQ9BSW2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CRACR2AQ9BSW2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CRACR2AQ9BSW2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CRACR2AQ9BSW2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CRACR2AQ9BSW2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CRACR2AQ9BSW2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CRACR2AQ9BSW2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CRACR2AQ9BSW2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CRACR2AQ9BSW2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CRACR2AQ9BSW2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CRACR2AQ9BSW2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRACR2AQ9BSW2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRACR2AQ9BSW2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRACR2AQ9BSW2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRACR2AQ9BSW2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRACR2AQ9BSW2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRACR2AQ9BSW2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRACR2AQ9BSW2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRACR2AQ9BSW2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRACR2AQ9BSW2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRACR2AQ9BSW2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRACR2AQ9BSW2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRACR2AQ9BSW2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRACR2AQ9BSW2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRACR2AQ9BSW2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CRACR2AQ9BSW2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CRACR2AQ9BSW2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CRACR2AQ9BSW2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CRACR2AQ9BSW2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CRACR2AQ9BSW2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CRACR2AQ9BSW2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRACR2AQ9BSW2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRACR2AQ9BSW2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRACR2AQ9BSW2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRACR2AQ9BSW2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRACR2AQ9BSW2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRACR2AQ9BSW2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRACR2AQ9BSW2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRACR2AQ9BSW2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRACR2AQ9BSW2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRACR2AQ9BSW2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms