Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBA1CQ9BQE3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBA1CQ9BQE3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBA1CQ9BQE3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBA1CQ9BQE3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBA1CQ9BQE3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBA1CQ9BQE3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBA1CQ9BQE3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBA1CQ9BQE3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBA1CQ9BQE3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBA1CQ9BQE3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBA1CQ9BQE3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBA1CQ9BQE3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBA1CQ9BQE3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBA1CQ9BQE3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBA1CQ9BQE3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBA1CQ9BQE3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBA1CQ9BQE3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBA1CQ9BQE3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TUBA1CQ9BQE3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBA1CQ9BQE3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBA1CQ9BQE3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBA1CQ9BQE3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBA1CQ9BQE3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBA1CQ9BQE3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBA1CQ9BQE3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBA1CQ9BQE3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBA1CQ9BQE3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBA1CQ9BQE3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBA1CQ9BQE3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBA1CQ9BQE3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBA1CQ9BQE3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBA1CQ9BQE3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBA1CQ9BQE3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBA1CQ9BQE3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBA1CQ9BQE3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBA1CQ9BQE3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBA1CQ9BQE3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBA1CQ9BQE3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBA1CQ9BQE3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBA1CQ9BQE3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBA1CQ9BQE3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBA1CQ9BQE3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBA1CQ9BQE3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBA1CQ9BQE3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBA1CQ9BQE3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBA1CQ9BQE3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBA1CQ9BQE3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBA1CQ9BQE3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBA1CQ9BQE3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBA1CQ9BQE3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBA1CQ9BQE3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBA1CQ9BQE3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBA1CQ9BQE3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBA1CQ9BQE3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBA1CQ9BQE3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBA1CQ9BQE3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBA1CQ9BQE3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBA1CQ9BQE3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBA1CQ9BQE3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBA1CQ9BQE3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBA1CQ9BQE3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBA1CQ9BQE3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBA1CQ9BQE3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBA1CQ9BQE3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBA1CQ9BQE3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBA1CQ9BQE3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBA1CQ9BQE3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBA1CQ9BQE3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBA1CQ9BQE3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBA1CQ9BQE3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBA1CQ9BQE3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBA1CQ9BQE3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBA1CQ9BQE3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBA1CQ9BQE3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBA1CQ9BQE3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBA1CQ9BQE3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBA1CQ9BQE3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBA1CQ9BQE3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBA1CQ9BQE3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBA1CQ9BQE3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBA1CQ9BQE3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBA1CQ9BQE3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBA1CQ9BQE3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBA1CQ9BQE3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBA1CQ9BQE3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBA1CQ9BQE3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBA1CQ9BQE3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBA1CQ9BQE3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBA1CQ9BQE3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBA1CQ9BQE3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBA1CQ9BQE3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBA1CQ9BQE3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBA1CQ9BQE3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBA1CQ9BQE3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBA1CQ9BQE3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBA1CQ9BQE3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBA1CQ9BQE3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBA1CQ9BQE3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBA1CQ9BQE3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126 ms