Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TREX2Q9BQ50 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TREX2Q9BQ50 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TREX2Q9BQ50 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TREX2Q9BQ50 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TREX2Q9BQ50 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TREX2Q9BQ50 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TREX2Q9BQ50 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TREX2Q9BQ50 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TREX2Q9BQ50 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TREX2Q9BQ50 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TREX2Q9BQ50 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TREX2Q9BQ50 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TREX2Q9BQ50 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TREX2Q9BQ50 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TREX2Q9BQ50 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TREX2Q9BQ50 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TREX2Q9BQ50 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TREX2Q9BQ50 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TREX2Q9BQ50 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TREX2Q9BQ50 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TREX2Q9BQ50 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TREX2Q9BQ50 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TREX2Q9BQ50 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TREX2Q9BQ50 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TREX2Q9BQ50 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TREX2Q9BQ50 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TREX2Q9BQ50 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TREX2Q9BQ50 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TREX2Q9BQ50 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TREX2Q9BQ50 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TREX2Q9BQ50 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TREX2Q9BQ50 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TREX2Q9BQ50 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TREX2Q9BQ50 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TREX2Q9BQ50 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TREX2Q9BQ50 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TREX2Q9BQ50 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TREX2Q9BQ50 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TREX2Q9BQ50 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TREX2Q9BQ50 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TREX2Q9BQ50 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TREX2Q9BQ50 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TREX2Q9BQ50 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TREX2Q9BQ50 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TREX2Q9BQ50 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TREX2Q9BQ50 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TREX2Q9BQ50 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TREX2Q9BQ50 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TREX2Q9BQ50 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TREX2Q9BQ50 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TREX2Q9BQ50 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TREX2Q9BQ50 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TREX2Q9BQ50 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TREX2Q9BQ50 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TREX2Q9BQ50 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TREX2Q9BQ50 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TREX2Q9BQ50 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TREX2Q9BQ50 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TREX2Q9BQ50 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TREX2Q9BQ50 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TREX2Q9BQ50 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TREX2Q9BQ50 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TREX2Q9BQ50 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TREX2Q9BQ50 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TREX2Q9BQ50 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TREX2Q9BQ50 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TREX2Q9BQ50 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TREX2Q9BQ50 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TREX2Q9BQ50 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TREX2Q9BQ50 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TREX2Q9BQ50 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TREX2Q9BQ50 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TREX2Q9BQ50 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TREX2Q9BQ50 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TREX2Q9BQ50 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TREX2Q9BQ50 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TREX2Q9BQ50 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TREX2Q9BQ50 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TREX2Q9BQ50 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TREX2Q9BQ50 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TREX2Q9BQ50 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TREX2Q9BQ50 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TREX2Q9BQ50 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TREX2Q9BQ50 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TREX2Q9BQ50 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TREX2Q9BQ50 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TREX2Q9BQ50 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TREX2Q9BQ50 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TREX2Q9BQ50 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TREX2Q9BQ50 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TREX2Q9BQ50 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TREX2Q9BQ50 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TREX2Q9BQ50 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TREX2Q9BQ50 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TREX2Q9BQ50 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TREX2Q9BQ50 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TREX2Q9BQ50 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TREX2Q9BQ50 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TREX2Q9BQ50 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.6 ms