Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DUSP9Q99956 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DUSP9Q99956 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DUSP9Q99956 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DUSP9Q99956 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DUSP9Q99956 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DUSP9Q99956 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
DUSP9Q99956 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DUSP9Q99956 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DUSP9Q99956 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DUSP9Q99956 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DUSP9Q99956 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DUSP9Q99956 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DUSP9Q99956 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DUSP9Q99956 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DUSP9Q99956 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DUSP9Q99956 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DUSP9Q99956 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DUSP9Q99956 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
DUSP9Q99956 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DUSP9Q99956 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DUSP9Q99956 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DUSP9Q99956 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DUSP9Q99956 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
DUSP9Q99956 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DUSP9Q99956 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DUSP9Q99956 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DUSP9Q99956 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DUSP9Q99956 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DUSP9Q99956 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DUSP9Q99956 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DUSP9Q99956 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DUSP9Q99956 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DUSP9Q99956 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DUSP9Q99956 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DUSP9Q99956 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DUSP9Q99956 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DUSP9Q99956 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DUSP9Q99956 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DUSP9Q99956 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DUSP9Q99956 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DUSP9Q99956 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
DUSP9Q99956 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DUSP9Q99956 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DUSP9Q99956 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
DUSP9Q99956 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DUSP9Q99956 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DUSP9Q99956 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DUSP9Q99956 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DUSP9Q99956 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DUSP9Q99956 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DUSP9Q99956 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DUSP9Q99956 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
DUSP9Q99956 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DUSP9Q99956 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DUSP9Q99956 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DUSP9Q99956 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DUSP9Q99956 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DUSP9Q99956 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DUSP9Q99956 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DUSP9Q99956 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
DUSP9Q99956 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DUSP9Q99956 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DUSP9Q99956 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
DUSP9Q99956 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DUSP9Q99956 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DUSP9Q99956 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
DUSP9Q99956 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DUSP9Q99956 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DUSP9Q99956 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DUSP9Q99956 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DUSP9Q99956 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DUSP9Q99956 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DUSP9Q99956 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DUSP9Q99956 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DUSP9Q99956 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
DUSP9Q99956 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DUSP9Q99956 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DUSP9Q99956 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DUSP9Q99956 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DUSP9Q99956 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DUSP9Q99956 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DUSP9Q99956 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DUSP9Q99956 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DUSP9Q99956 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DUSP9Q99956 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
DUSP9Q99956 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DUSP9Q99956 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DUSP9Q99956 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DUSP9Q99956 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
DUSP9Q99956 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
DUSP9Q99956 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DUSP9Q99956 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
DUSP9Q99956 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DUSP9Q99956 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DUSP9Q99956 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DUSP9Q99956 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DUSP9Q99956 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DUSP9Q99956 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DUSP9Q99956 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms