Protein–RNA interactions for Protein: Q99805

TM9SF2, Transmembrane 9 superfamily member 2, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF2Q99805 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM9SF2Q99805 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM9SF2Q99805 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM9SF2Q99805 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM9SF2Q99805 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM9SF2Q99805 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM9SF2Q99805 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM9SF2Q99805 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM9SF2Q99805 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM9SF2Q99805 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM9SF2Q99805 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM9SF2Q99805 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM9SF2Q99805 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM9SF2Q99805 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM9SF2Q99805 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM9SF2Q99805 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM9SF2Q99805 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM9SF2Q99805 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM9SF2Q99805 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM9SF2Q99805 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM9SF2Q99805 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TM9SF2Q99805 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM9SF2Q99805 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM9SF2Q99805 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM9SF2Q99805 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM9SF2Q99805 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TM9SF2Q99805 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM9SF2Q99805 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM9SF2Q99805 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM9SF2Q99805 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM9SF2Q99805 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM9SF2Q99805 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM9SF2Q99805 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TM9SF2Q99805 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM9SF2Q99805 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TM9SF2Q99805 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TM9SF2Q99805 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM9SF2Q99805 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM9SF2Q99805 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM9SF2Q99805 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM9SF2Q99805 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM9SF2Q99805 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TM9SF2Q99805 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TM9SF2Q99805 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TM9SF2Q99805 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TM9SF2Q99805 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TM9SF2Q99805 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TM9SF2Q99805 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TM9SF2Q99805 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TM9SF2Q99805 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM9SF2Q99805 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM9SF2Q99805 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM9SF2Q99805 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TM9SF2Q99805 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM9SF2Q99805 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TM9SF2Q99805 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM9SF2Q99805 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM9SF2Q99805 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM9SF2Q99805 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM9SF2Q99805 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM9SF2Q99805 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM9SF2Q99805 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM9SF2Q99805 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM9SF2Q99805 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM9SF2Q99805 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM9SF2Q99805 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM9SF2Q99805 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM9SF2Q99805 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM9SF2Q99805 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TM9SF2Q99805 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TM9SF2Q99805 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM9SF2Q99805 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM9SF2Q99805 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM9SF2Q99805 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM9SF2Q99805 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM9SF2Q99805 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM9SF2Q99805 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TM9SF2Q99805 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TM9SF2Q99805 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TM9SF2Q99805 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM9SF2Q99805 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM9SF2Q99805 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM9SF2Q99805 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM9SF2Q99805 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM9SF2Q99805 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM9SF2Q99805 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM9SF2Q99805 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TM9SF2Q99805 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TM9SF2Q99805 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TM9SF2Q99805 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TM9SF2Q99805 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TM9SF2Q99805 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TM9SF2Q99805 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TM9SF2Q99805 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TM9SF2Q99805 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TM9SF2Q99805 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TM9SF2Q99805 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TM9SF2Q99805 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TM9SF2Q99805 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TM9SF2Q99805 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms