Protein–RNA interactions for Protein: Q99593

TBX5, T-box transcription factor TBX5, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX5Q99593 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TBX5Q99593 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TBX5Q99593 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TBX5Q99593 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TBX5Q99593 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TBX5Q99593 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TBX5Q99593 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TBX5Q99593 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TBX5Q99593 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TBX5Q99593 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TBX5Q99593 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TBX5Q99593 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TBX5Q99593 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TBX5Q99593 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TBX5Q99593 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TBX5Q99593 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TBX5Q99593 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TBX5Q99593 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TBX5Q99593 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TBX5Q99593 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TBX5Q99593 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TBX5Q99593 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TBX5Q99593 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TBX5Q99593 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TBX5Q99593 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TBX5Q99593 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TBX5Q99593 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TBX5Q99593 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TBX5Q99593 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TBX5Q99593 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TBX5Q99593 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TBX5Q99593 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TBX5Q99593 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TBX5Q99593 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TBX5Q99593 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TBX5Q99593 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TBX5Q99593 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TBX5Q99593 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TBX5Q99593 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TBX5Q99593 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TBX5Q99593 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TBX5Q99593 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TBX5Q99593 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TBX5Q99593 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TBX5Q99593 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TBX5Q99593 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TBX5Q99593 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TBX5Q99593 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TBX5Q99593 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TBX5Q99593 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TBX5Q99593 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TBX5Q99593 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TBX5Q99593 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TBX5Q99593 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TBX5Q99593 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TBX5Q99593 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TBX5Q99593 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TBX5Q99593 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TBX5Q99593 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TBX5Q99593 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TBX5Q99593 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TBX5Q99593 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TBX5Q99593 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TBX5Q99593 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TBX5Q99593 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TBX5Q99593 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TBX5Q99593 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TBX5Q99593 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TBX5Q99593 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TBX5Q99593 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TBX5Q99593 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TBX5Q99593 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TBX5Q99593 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TBX5Q99593 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TBX5Q99593 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TBX5Q99593 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TBX5Q99593 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TBX5Q99593 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TBX5Q99593 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TBX5Q99593 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TBX5Q99593 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TBX5Q99593 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TBX5Q99593 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TBX5Q99593 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.33■■□□□ 1
TBX5Q99593 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TBX5Q99593 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TBX5Q99593 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TBX5Q99593 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TBX5Q99593 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TBX5Q99593 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TBX5Q99593 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TBX5Q99593 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TBX5Q99593 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TBX5Q99593 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TBX5Q99593 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TBX5Q99593 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TBX5Q99593 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TBX5Q99593 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TBX5Q99593 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TBX5Q99593 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.3 ms