Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VAT1Q99536 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VAT1Q99536 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VAT1Q99536 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VAT1Q99536 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VAT1Q99536 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VAT1Q99536 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
VAT1Q99536 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VAT1Q99536 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VAT1Q99536 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VAT1Q99536 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VAT1Q99536 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VAT1Q99536 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VAT1Q99536 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VAT1Q99536 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VAT1Q99536 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VAT1Q99536 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VAT1Q99536 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VAT1Q99536 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VAT1Q99536 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VAT1Q99536 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VAT1Q99536 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VAT1Q99536 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VAT1Q99536 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VAT1Q99536 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VAT1Q99536 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VAT1Q99536 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VAT1Q99536 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VAT1Q99536 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VAT1Q99536 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VAT1Q99536 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VAT1Q99536 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VAT1Q99536 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VAT1Q99536 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VAT1Q99536 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VAT1Q99536 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VAT1Q99536 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VAT1Q99536 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
VAT1Q99536 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
VAT1Q99536 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
VAT1Q99536 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
VAT1Q99536 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VAT1Q99536 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VAT1Q99536 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VAT1Q99536 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
VAT1Q99536 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VAT1Q99536 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VAT1Q99536 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VAT1Q99536 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VAT1Q99536 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VAT1Q99536 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VAT1Q99536 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VAT1Q99536 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VAT1Q99536 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VAT1Q99536 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VAT1Q99536 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VAT1Q99536 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
VAT1Q99536 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
VAT1Q99536 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAT1Q99536 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAT1Q99536 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAT1Q99536 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAT1Q99536 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAT1Q99536 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
VAT1Q99536 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VAT1Q99536 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VAT1Q99536 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VAT1Q99536 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VAT1Q99536 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VAT1Q99536 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VAT1Q99536 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VAT1Q99536 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VAT1Q99536 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
VAT1Q99536 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VAT1Q99536 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VAT1Q99536 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VAT1Q99536 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VAT1Q99536 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
VAT1Q99536 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VAT1Q99536 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VAT1Q99536 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VAT1Q99536 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VAT1Q99536 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VAT1Q99536 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VAT1Q99536 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VAT1Q99536 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VAT1Q99536 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VAT1Q99536 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VAT1Q99536 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VAT1Q99536 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VAT1Q99536 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VAT1Q99536 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VAT1Q99536 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VAT1Q99536 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VAT1Q99536 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VAT1Q99536 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VAT1Q99536 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VAT1Q99536 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
VAT1Q99536 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VAT1Q99536 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms