Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
EYA3Q99504 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
EYA3Q99504 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
EYA3Q99504 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
EYA3Q99504 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
EYA3Q99504 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
EYA3Q99504 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
EYA3Q99504 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
EYA3Q99504 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
EYA3Q99504 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
EYA3Q99504 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
EYA3Q99504 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
EYA3Q99504 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
EYA3Q99504 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
EYA3Q99504 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
EYA3Q99504 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
EYA3Q99504 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
EYA3Q99504 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
EYA3Q99504 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
EYA3Q99504 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
EYA3Q99504 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
EYA3Q99504 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
EYA3Q99504 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
EYA3Q99504 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
EYA3Q99504 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
EYA3Q99504 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
EYA3Q99504 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
EYA3Q99504 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
EYA3Q99504 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
EYA3Q99504 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
EYA3Q99504 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
EYA3Q99504 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
EYA3Q99504 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
EYA3Q99504 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
EYA3Q99504 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
EYA3Q99504 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
EYA3Q99504 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
EYA3Q99504 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
EYA3Q99504 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
EYA3Q99504 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
EYA3Q99504 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
EYA3Q99504 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
EYA3Q99504 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
EYA3Q99504 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
EYA3Q99504 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
EYA3Q99504 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
EYA3Q99504 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
EYA3Q99504 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
EYA3Q99504 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
EYA3Q99504 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
EYA3Q99504 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
EYA3Q99504 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
EYA3Q99504 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
EYA3Q99504 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
EYA3Q99504 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
EYA3Q99504 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
EYA3Q99504 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
EYA3Q99504 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
EYA3Q99504 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
EYA3Q99504 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
EYA3Q99504 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
EYA3Q99504 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
EYA3Q99504 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
EYA3Q99504 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
EYA3Q99504 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
EYA3Q99504 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
EYA3Q99504 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
EYA3Q99504 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
EYA3Q99504 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
EYA3Q99504 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
EYA3Q99504 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
EYA3Q99504 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
EYA3Q99504 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
EYA3Q99504 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
EYA3Q99504 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
EYA3Q99504 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
EYA3Q99504 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
EYA3Q99504 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
EYA3Q99504 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
EYA3Q99504 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
EYA3Q99504 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
EYA3Q99504 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
EYA3Q99504 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
EYA3Q99504 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
EYA3Q99504 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
EYA3Q99504 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
EYA3Q99504 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
EYA3Q99504 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
EYA3Q99504 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
EYA3Q99504 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
EYA3Q99504 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
EYA3Q99504 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EYA3Q99504 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EYA3Q99504 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
EYA3Q99504 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
EYA3Q99504 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
EYA3Q99504 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
EYA3Q99504 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EYA3Q99504 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
EYA3Q99504 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms