Protein–RNA interactions for Protein: Q96T76

MMS19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMS19Q96T76 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MMS19Q96T76 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
MMS19Q96T76 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MMS19Q96T76 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MMS19Q96T76 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
MMS19Q96T76 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MMS19Q96T76 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MMS19Q96T76 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MMS19Q96T76 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
MMS19Q96T76 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MMS19Q96T76 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MMS19Q96T76 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MMS19Q96T76 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MMS19Q96T76 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MMS19Q96T76 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
MMS19Q96T76 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MMS19Q96T76 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MMS19Q96T76 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MMS19Q96T76 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MMS19Q96T76 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MMS19Q96T76 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MMS19Q96T76 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MMS19Q96T76 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MMS19Q96T76 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MMS19Q96T76 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MMS19Q96T76 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MMS19Q96T76 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MMS19Q96T76 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MMS19Q96T76 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MMS19Q96T76 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MMS19Q96T76 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MMS19Q96T76 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MMS19Q96T76 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MMS19Q96T76 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MMS19Q96T76 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MMS19Q96T76 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
MMS19Q96T76 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MMS19Q96T76 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MMS19Q96T76 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MMS19Q96T76 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MMS19Q96T76 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MMS19Q96T76 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MMS19Q96T76 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
MMS19Q96T76 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MMS19Q96T76 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MMS19Q96T76 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
MMS19Q96T76 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MMS19Q96T76 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MMS19Q96T76 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MMS19Q96T76 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MMS19Q96T76 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MMS19Q96T76 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MMS19Q96T76 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
MMS19Q96T76 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MMS19Q96T76 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MMS19Q96T76 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MMS19Q96T76 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MMS19Q96T76 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MMS19Q96T76 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MMS19Q96T76 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
MMS19Q96T76 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MMS19Q96T76 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MMS19Q96T76 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MMS19Q96T76 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MMS19Q96T76 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MMS19Q96T76 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MMS19Q96T76 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MMS19Q96T76 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MMS19Q96T76 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MMS19Q96T76 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MMS19Q96T76 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MMS19Q96T76 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MMS19Q96T76 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MMS19Q96T76 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MMS19Q96T76 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MMS19Q96T76 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MMS19Q96T76 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MMS19Q96T76 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MMS19Q96T76 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MMS19Q96T76 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MMS19Q96T76 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MMS19Q96T76 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MMS19Q96T76 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
MMS19Q96T76 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MMS19Q96T76 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MMS19Q96T76 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MMS19Q96T76 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MMS19Q96T76 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
MMS19Q96T76 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MMS19Q96T76 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MMS19Q96T76 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MMS19Q96T76 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MMS19Q96T76 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MMS19Q96T76 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
MMS19Q96T76 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MMS19Q96T76 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MMS19Q96T76 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MMS19Q96T76 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MMS19Q96T76 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MMS19Q96T76 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms