Protein–RNA interactions for Protein: Q96T23

RSF1, Remodeling and spacing factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSF1Q96T23 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC43.64■■■■■ 4.58
RSF1Q96T23 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC43.64■■■■■ 4.58
RSF1Q96T23 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.58
RSF1Q96T23 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC43.63■■■■■ 4.57
RSF1Q96T23 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.57
RSF1Q96T23 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC43.63■■■■■ 4.57
RSF1Q96T23 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
RSF1Q96T23 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC43.62■■■■■ 4.57
RSF1Q96T23 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
RSF1Q96T23 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC43.61■■■■■ 4.57
RSF1Q96T23 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
RSF1Q96T23 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.6■■■■■ 4.57
RSF1Q96T23 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC43.6■■■■■ 4.57
RSF1Q96T23 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.6■■■■■ 4.57
RSF1Q96T23 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
RSF1Q96T23 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
RSF1Q96T23 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
RSF1Q96T23 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
RSF1Q96T23 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC43.57■■■■■ 4.57
RSF1Q96T23 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC43.57■■■■■ 4.57
RSF1Q96T23 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
RSF1Q96T23 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
RSF1Q96T23 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC43.56■■■■■ 4.56
RSF1Q96T23 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC43.56■■■■■ 4.56
RSF1Q96T23 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
RSF1Q96T23 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC43.56■■■■■ 4.56
RSF1Q96T23 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
RSF1Q96T23 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
RSF1Q96T23 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC43.54■■■■■ 4.56
RSF1Q96T23 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
RSF1Q96T23 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
RSF1Q96T23 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
RSF1Q96T23 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
RSF1Q96T23 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
RSF1Q96T23 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
RSF1Q96T23 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
RSF1Q96T23 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC43.53■■■■■ 4.56
RSF1Q96T23 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC43.53■■■■■ 4.56
RSF1Q96T23 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.53■■■■■ 4.56
RSF1Q96T23 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
RSF1Q96T23 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
RSF1Q96T23 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.53■■■■■ 4.56
RSF1Q96T23 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
RSF1Q96T23 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC43.52■■■■■ 4.56
RSF1Q96T23 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC43.51■■■■■ 4.56
RSF1Q96T23 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.51■■■■■ 4.56
RSF1Q96T23 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
RSF1Q96T23 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
RSF1Q96T23 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
RSF1Q96T23 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC43.48■■■■■ 4.55
RSF1Q96T23 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
RSF1Q96T23 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
RSF1Q96T23 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
RSF1Q96T23 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC43.48■■■■■ 4.55
RSF1Q96T23 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.48■■■■■ 4.55
RSF1Q96T23 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
RSF1Q96T23 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC43.47■■■■■ 4.55
RSF1Q96T23 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
RSF1Q96T23 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC43.47■■■■■ 4.55
RSF1Q96T23 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC43.47■■■■■ 4.55
RSF1Q96T23 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC43.46■■■■■ 4.55
RSF1Q96T23 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
RSF1Q96T23 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.46■■■■■ 4.55
RSF1Q96T23 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC43.46■■■■■ 4.55
RSF1Q96T23 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC43.46■■■■■ 4.55
RSF1Q96T23 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC43.45■■■■■ 4.55
RSF1Q96T23 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC43.44■■■■■ 4.54
RSF1Q96T23 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC43.44■■■■■ 4.54
RSF1Q96T23 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.43■■■■■ 4.54
RSF1Q96T23 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.43■■■■■ 4.54
RSF1Q96T23 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
RSF1Q96T23 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
RSF1Q96T23 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC43.42■■■■■ 4.54
RSF1Q96T23 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.42■■■■■ 4.54
RSF1Q96T23 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
RSF1Q96T23 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC43.41■■■■■ 4.54
RSF1Q96T23 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC43.41■■■■■ 4.54
RSF1Q96T23 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC43.41■■■■■ 4.54
RSF1Q96T23 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC43.4■■■■■ 4.54
RSF1Q96T23 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC43.4■■■■■ 4.54
RSF1Q96T23 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
RSF1Q96T23 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
RSF1Q96T23 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
RSF1Q96T23 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC43.39■■■■■ 4.54
RSF1Q96T23 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC43.39■■■■■ 4.54
RSF1Q96T23 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC43.39■■■■■ 4.54
RSF1Q96T23 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
RSF1Q96T23 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC43.39■■■■■ 4.54
RSF1Q96T23 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC43.39■■■■■ 4.54
RSF1Q96T23 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC43.39■■■■■ 4.54
RSF1Q96T23 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC43.39■■■■■ 4.54
RSF1Q96T23 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC43.39■■■■■ 4.54
RSF1Q96T23 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.54
RSF1Q96T23 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.54
RSF1Q96T23 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.54
RSF1Q96T23 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.53
RSF1Q96T23 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.38■■■■■ 4.53
RSF1Q96T23 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC43.38■■■■■ 4.53
RSF1Q96T23 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.38■■■■■ 4.53
RSF1Q96T23 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms