Protein–RNA interactions for Protein: Q96SM3

CPXM1, Probable carboxypeptidase X1, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPXM1Q96SM3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CPXM1Q96SM3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CPXM1Q96SM3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CPXM1Q96SM3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CPXM1Q96SM3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPXM1Q96SM3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPXM1Q96SM3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPXM1Q96SM3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPXM1Q96SM3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPXM1Q96SM3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPXM1Q96SM3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPXM1Q96SM3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPXM1Q96SM3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPXM1Q96SM3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPXM1Q96SM3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPXM1Q96SM3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPXM1Q96SM3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPXM1Q96SM3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CPXM1Q96SM3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CPXM1Q96SM3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPXM1Q96SM3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPXM1Q96SM3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPXM1Q96SM3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPXM1Q96SM3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPXM1Q96SM3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPXM1Q96SM3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPXM1Q96SM3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPXM1Q96SM3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPXM1Q96SM3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPXM1Q96SM3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPXM1Q96SM3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPXM1Q96SM3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPXM1Q96SM3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPXM1Q96SM3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPXM1Q96SM3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPXM1Q96SM3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPXM1Q96SM3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPXM1Q96SM3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPXM1Q96SM3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPXM1Q96SM3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPXM1Q96SM3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPXM1Q96SM3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPXM1Q96SM3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPXM1Q96SM3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPXM1Q96SM3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPXM1Q96SM3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPXM1Q96SM3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPXM1Q96SM3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPXM1Q96SM3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPXM1Q96SM3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPXM1Q96SM3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPXM1Q96SM3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPXM1Q96SM3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPXM1Q96SM3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPXM1Q96SM3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPXM1Q96SM3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CPXM1Q96SM3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPXM1Q96SM3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPXM1Q96SM3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPXM1Q96SM3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPXM1Q96SM3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPXM1Q96SM3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPXM1Q96SM3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CPXM1Q96SM3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPXM1Q96SM3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPXM1Q96SM3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPXM1Q96SM3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CPXM1Q96SM3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPXM1Q96SM3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPXM1Q96SM3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPXM1Q96SM3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPXM1Q96SM3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPXM1Q96SM3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPXM1Q96SM3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPXM1Q96SM3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPXM1Q96SM3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CPXM1Q96SM3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPXM1Q96SM3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPXM1Q96SM3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPXM1Q96SM3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CPXM1Q96SM3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPXM1Q96SM3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPXM1Q96SM3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPXM1Q96SM3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CPXM1Q96SM3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPXM1Q96SM3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPXM1Q96SM3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPXM1Q96SM3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPXM1Q96SM3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPXM1Q96SM3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPXM1Q96SM3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPXM1Q96SM3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPXM1Q96SM3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPXM1Q96SM3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPXM1Q96SM3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPXM1Q96SM3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPXM1Q96SM3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CPXM1Q96SM3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPXM1Q96SM3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPXM1Q96SM3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms