Protein–RNA interactions for Protein: Q96S90

LYSMD1, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD1Q96S90 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LYSMD1Q96S90 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LYSMD1Q96S90 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LYSMD1Q96S90 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LYSMD1Q96S90 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LYSMD1Q96S90 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LYSMD1Q96S90 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LYSMD1Q96S90 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LYSMD1Q96S90 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LYSMD1Q96S90 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LYSMD1Q96S90 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LYSMD1Q96S90 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LYSMD1Q96S90 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LYSMD1Q96S90 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LYSMD1Q96S90 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LYSMD1Q96S90 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LYSMD1Q96S90 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LYSMD1Q96S90 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LYSMD1Q96S90 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LYSMD1Q96S90 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LYSMD1Q96S90 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LYSMD1Q96S90 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LYSMD1Q96S90 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LYSMD1Q96S90 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LYSMD1Q96S90 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LYSMD1Q96S90 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LYSMD1Q96S90 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LYSMD1Q96S90 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LYSMD1Q96S90 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LYSMD1Q96S90 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LYSMD1Q96S90 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LYSMD1Q96S90 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LYSMD1Q96S90 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LYSMD1Q96S90 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LYSMD1Q96S90 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LYSMD1Q96S90 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LYSMD1Q96S90 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LYSMD1Q96S90 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LYSMD1Q96S90 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LYSMD1Q96S90 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LYSMD1Q96S90 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LYSMD1Q96S90 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LYSMD1Q96S90 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LYSMD1Q96S90 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LYSMD1Q96S90 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LYSMD1Q96S90 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LYSMD1Q96S90 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LYSMD1Q96S90 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LYSMD1Q96S90 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LYSMD1Q96S90 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LYSMD1Q96S90 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LYSMD1Q96S90 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LYSMD1Q96S90 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LYSMD1Q96S90 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LYSMD1Q96S90 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LYSMD1Q96S90 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
LYSMD1Q96S90 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LYSMD1Q96S90 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LYSMD1Q96S90 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LYSMD1Q96S90 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LYSMD1Q96S90 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LYSMD1Q96S90 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LYSMD1Q96S90 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LYSMD1Q96S90 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LYSMD1Q96S90 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LYSMD1Q96S90 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LYSMD1Q96S90 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LYSMD1Q96S90 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LYSMD1Q96S90 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LYSMD1Q96S90 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LYSMD1Q96S90 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LYSMD1Q96S90 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LYSMD1Q96S90 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LYSMD1Q96S90 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LYSMD1Q96S90 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LYSMD1Q96S90 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LYSMD1Q96S90 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LYSMD1Q96S90 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LYSMD1Q96S90 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LYSMD1Q96S90 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LYSMD1Q96S90 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LYSMD1Q96S90 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LYSMD1Q96S90 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LYSMD1Q96S90 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LYSMD1Q96S90 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LYSMD1Q96S90 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LYSMD1Q96S90 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LYSMD1Q96S90 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LYSMD1Q96S90 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LYSMD1Q96S90 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LYSMD1Q96S90 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LYSMD1Q96S90 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LYSMD1Q96S90 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LYSMD1Q96S90 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LYSMD1Q96S90 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LYSMD1Q96S90 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LYSMD1Q96S90 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LYSMD1Q96S90 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LYSMD1Q96S90 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LYSMD1Q96S90 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms