Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CITED4Q96RK1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CITED4Q96RK1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CITED4Q96RK1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CITED4Q96RK1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CITED4Q96RK1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CITED4Q96RK1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CITED4Q96RK1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CITED4Q96RK1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CITED4Q96RK1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CITED4Q96RK1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CITED4Q96RK1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CITED4Q96RK1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CITED4Q96RK1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CITED4Q96RK1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CITED4Q96RK1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CITED4Q96RK1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CITED4Q96RK1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CITED4Q96RK1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CITED4Q96RK1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CITED4Q96RK1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CITED4Q96RK1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CITED4Q96RK1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CITED4Q96RK1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CITED4Q96RK1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CITED4Q96RK1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CITED4Q96RK1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CITED4Q96RK1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CITED4Q96RK1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CITED4Q96RK1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CITED4Q96RK1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CITED4Q96RK1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CITED4Q96RK1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CITED4Q96RK1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CITED4Q96RK1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CITED4Q96RK1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CITED4Q96RK1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CITED4Q96RK1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CITED4Q96RK1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CITED4Q96RK1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CITED4Q96RK1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CITED4Q96RK1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CITED4Q96RK1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CITED4Q96RK1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CITED4Q96RK1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CITED4Q96RK1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CITED4Q96RK1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CITED4Q96RK1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CITED4Q96RK1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CITED4Q96RK1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CITED4Q96RK1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CITED4Q96RK1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CITED4Q96RK1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CITED4Q96RK1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CITED4Q96RK1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CITED4Q96RK1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CITED4Q96RK1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CITED4Q96RK1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CITED4Q96RK1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CITED4Q96RK1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CITED4Q96RK1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CITED4Q96RK1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CITED4Q96RK1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CITED4Q96RK1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CITED4Q96RK1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CITED4Q96RK1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CITED4Q96RK1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CITED4Q96RK1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CITED4Q96RK1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CITED4Q96RK1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CITED4Q96RK1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CITED4Q96RK1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CITED4Q96RK1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CITED4Q96RK1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CITED4Q96RK1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CITED4Q96RK1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CITED4Q96RK1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CITED4Q96RK1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CITED4Q96RK1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CITED4Q96RK1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CITED4Q96RK1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CITED4Q96RK1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CITED4Q96RK1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CITED4Q96RK1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CITED4Q96RK1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CITED4Q96RK1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CITED4Q96RK1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CITED4Q96RK1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CITED4Q96RK1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CITED4Q96RK1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CITED4Q96RK1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CITED4Q96RK1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CITED4Q96RK1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CITED4Q96RK1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CITED4Q96RK1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CITED4Q96RK1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CITED4Q96RK1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CITED4Q96RK1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CITED4Q96RK1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CITED4Q96RK1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms