Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RUNDC3BQ96NL0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RUNDC3BQ96NL0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RUNDC3BQ96NL0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RUNDC3BQ96NL0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RUNDC3BQ96NL0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RUNDC3BQ96NL0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RUNDC3BQ96NL0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUNDC3BQ96NL0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUNDC3BQ96NL0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUNDC3BQ96NL0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUNDC3BQ96NL0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUNDC3BQ96NL0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUNDC3BQ96NL0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUNDC3BQ96NL0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUNDC3BQ96NL0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUNDC3BQ96NL0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUNDC3BQ96NL0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RUNDC3BQ96NL0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RUNDC3BQ96NL0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUNDC3BQ96NL0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUNDC3BQ96NL0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUNDC3BQ96NL0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUNDC3BQ96NL0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RUNDC3BQ96NL0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUNDC3BQ96NL0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUNDC3BQ96NL0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUNDC3BQ96NL0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUNDC3BQ96NL0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUNDC3BQ96NL0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUNDC3BQ96NL0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUNDC3BQ96NL0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUNDC3BQ96NL0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RUNDC3BQ96NL0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RUNDC3BQ96NL0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RUNDC3BQ96NL0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUNDC3BQ96NL0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUNDC3BQ96NL0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUNDC3BQ96NL0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUNDC3BQ96NL0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUNDC3BQ96NL0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUNDC3BQ96NL0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUNDC3BQ96NL0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUNDC3BQ96NL0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUNDC3BQ96NL0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUNDC3BQ96NL0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUNDC3BQ96NL0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUNDC3BQ96NL0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUNDC3BQ96NL0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RUNDC3BQ96NL0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUNDC3BQ96NL0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUNDC3BQ96NL0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUNDC3BQ96NL0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUNDC3BQ96NL0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUNDC3BQ96NL0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUNDC3BQ96NL0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUNDC3BQ96NL0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUNDC3BQ96NL0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RUNDC3BQ96NL0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUNDC3BQ96NL0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUNDC3BQ96NL0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUNDC3BQ96NL0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUNDC3BQ96NL0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUNDC3BQ96NL0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUNDC3BQ96NL0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUNDC3BQ96NL0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RUNDC3BQ96NL0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUNDC3BQ96NL0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUNDC3BQ96NL0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUNDC3BQ96NL0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUNDC3BQ96NL0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUNDC3BQ96NL0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUNDC3BQ96NL0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUNDC3BQ96NL0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUNDC3BQ96NL0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUNDC3BQ96NL0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUNDC3BQ96NL0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUNDC3BQ96NL0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUNDC3BQ96NL0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUNDC3BQ96NL0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RUNDC3BQ96NL0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUNDC3BQ96NL0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUNDC3BQ96NL0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUNDC3BQ96NL0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUNDC3BQ96NL0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUNDC3BQ96NL0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUNDC3BQ96NL0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUNDC3BQ96NL0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUNDC3BQ96NL0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUNDC3BQ96NL0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUNDC3BQ96NL0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUNDC3BQ96NL0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RUNDC3BQ96NL0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RUNDC3BQ96NL0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RUNDC3BQ96NL0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RUNDC3BQ96NL0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RUNDC3BQ96NL0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RUNDC3BQ96NL0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RUNDC3BQ96NL0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUNDC3BQ96NL0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms