Protein–RNA interactions for Protein: Q96N03

VSTM2L, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2LQ96N03 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSTM2LQ96N03 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSTM2LQ96N03 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSTM2LQ96N03 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSTM2LQ96N03 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSTM2LQ96N03 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSTM2LQ96N03 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSTM2LQ96N03 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSTM2LQ96N03 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSTM2LQ96N03 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
VSTM2LQ96N03 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSTM2LQ96N03 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VSTM2LQ96N03 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VSTM2LQ96N03 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VSTM2LQ96N03 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VSTM2LQ96N03 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VSTM2LQ96N03 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
VSTM2LQ96N03 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VSTM2LQ96N03 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VSTM2LQ96N03 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VSTM2LQ96N03 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VSTM2LQ96N03 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VSTM2LQ96N03 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VSTM2LQ96N03 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VSTM2LQ96N03 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VSTM2LQ96N03 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VSTM2LQ96N03 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VSTM2LQ96N03 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VSTM2LQ96N03 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VSTM2LQ96N03 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VSTM2LQ96N03 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VSTM2LQ96N03 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VSTM2LQ96N03 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VSTM2LQ96N03 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VSTM2LQ96N03 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VSTM2LQ96N03 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSTM2LQ96N03 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSTM2LQ96N03 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSTM2LQ96N03 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSTM2LQ96N03 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSTM2LQ96N03 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSTM2LQ96N03 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSTM2LQ96N03 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSTM2LQ96N03 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSTM2LQ96N03 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSTM2LQ96N03 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSTM2LQ96N03 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSTM2LQ96N03 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSTM2LQ96N03 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VSTM2LQ96N03 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VSTM2LQ96N03 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VSTM2LQ96N03 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VSTM2LQ96N03 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VSTM2LQ96N03 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
VSTM2LQ96N03 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VSTM2LQ96N03 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VSTM2LQ96N03 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VSTM2LQ96N03 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSTM2LQ96N03 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSTM2LQ96N03 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSTM2LQ96N03 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
VSTM2LQ96N03 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSTM2LQ96N03 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSTM2LQ96N03 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSTM2LQ96N03 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSTM2LQ96N03 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
VSTM2LQ96N03 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSTM2LQ96N03 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
VSTM2LQ96N03 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSTM2LQ96N03 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSTM2LQ96N03 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSTM2LQ96N03 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSTM2LQ96N03 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSTM2LQ96N03 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSTM2LQ96N03 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSTM2LQ96N03 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSTM2LQ96N03 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSTM2LQ96N03 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSTM2LQ96N03 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSTM2LQ96N03 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSTM2LQ96N03 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSTM2LQ96N03 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSTM2LQ96N03 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSTM2LQ96N03 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSTM2LQ96N03 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSTM2LQ96N03 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSTM2LQ96N03 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSTM2LQ96N03 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSTM2LQ96N03 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VSTM2LQ96N03 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSTM2LQ96N03 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSTM2LQ96N03 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSTM2LQ96N03 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
VSTM2LQ96N03 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSTM2LQ96N03 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
VSTM2LQ96N03 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSTM2LQ96N03 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSTM2LQ96N03 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSTM2LQ96N03 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSTM2LQ96N03 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms