Protein–RNA interactions for Protein: Q96MS0

ROBO3, Roundabout homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROBO3Q96MS0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ROBO3Q96MS0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ROBO3Q96MS0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ROBO3Q96MS0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ROBO3Q96MS0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ROBO3Q96MS0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
ROBO3Q96MS0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ROBO3Q96MS0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ROBO3Q96MS0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ROBO3Q96MS0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ROBO3Q96MS0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ROBO3Q96MS0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ROBO3Q96MS0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ROBO3Q96MS0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ROBO3Q96MS0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ROBO3Q96MS0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ROBO3Q96MS0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ROBO3Q96MS0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ROBO3Q96MS0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ROBO3Q96MS0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ROBO3Q96MS0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ROBO3Q96MS0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ROBO3Q96MS0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ROBO3Q96MS0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ROBO3Q96MS0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ROBO3Q96MS0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ROBO3Q96MS0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ROBO3Q96MS0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ROBO3Q96MS0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ROBO3Q96MS0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ROBO3Q96MS0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ROBO3Q96MS0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ROBO3Q96MS0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ROBO3Q96MS0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ROBO3Q96MS0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ROBO3Q96MS0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ROBO3Q96MS0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ROBO3Q96MS0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ROBO3Q96MS0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ROBO3Q96MS0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ROBO3Q96MS0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ROBO3Q96MS0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ROBO3Q96MS0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ROBO3Q96MS0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ROBO3Q96MS0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ROBO3Q96MS0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ROBO3Q96MS0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ROBO3Q96MS0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ROBO3Q96MS0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ROBO3Q96MS0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ROBO3Q96MS0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ROBO3Q96MS0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ROBO3Q96MS0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ROBO3Q96MS0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ROBO3Q96MS0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ROBO3Q96MS0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ROBO3Q96MS0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ROBO3Q96MS0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ROBO3Q96MS0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ROBO3Q96MS0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ROBO3Q96MS0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ROBO3Q96MS0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ROBO3Q96MS0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ROBO3Q96MS0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ROBO3Q96MS0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ROBO3Q96MS0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ROBO3Q96MS0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ROBO3Q96MS0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ROBO3Q96MS0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ROBO3Q96MS0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ROBO3Q96MS0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ROBO3Q96MS0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ROBO3Q96MS0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ROBO3Q96MS0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ROBO3Q96MS0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ROBO3Q96MS0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ROBO3Q96MS0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ROBO3Q96MS0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ROBO3Q96MS0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ROBO3Q96MS0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ROBO3Q96MS0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ROBO3Q96MS0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ROBO3Q96MS0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ROBO3Q96MS0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ROBO3Q96MS0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ROBO3Q96MS0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ROBO3Q96MS0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ROBO3Q96MS0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ROBO3Q96MS0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ROBO3Q96MS0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ROBO3Q96MS0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ROBO3Q96MS0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ROBO3Q96MS0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ROBO3Q96MS0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ROBO3Q96MS0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ROBO3Q96MS0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ROBO3Q96MS0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ROBO3Q96MS0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ROBO3Q96MS0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ROBO3Q96MS0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms