Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf85Q96MD7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf85Q96MD7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf85Q96MD7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf85Q96MD7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf85Q96MD7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf85Q96MD7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf85Q96MD7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf85Q96MD7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf85Q96MD7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf85Q96MD7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf85Q96MD7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
C9orf85Q96MD7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
C9orf85Q96MD7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf85Q96MD7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf85Q96MD7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf85Q96MD7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf85Q96MD7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf85Q96MD7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf85Q96MD7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf85Q96MD7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf85Q96MD7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf85Q96MD7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf85Q96MD7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf85Q96MD7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf85Q96MD7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf85Q96MD7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf85Q96MD7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf85Q96MD7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf85Q96MD7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf85Q96MD7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf85Q96MD7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf85Q96MD7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf85Q96MD7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf85Q96MD7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf85Q96MD7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf85Q96MD7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf85Q96MD7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf85Q96MD7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf85Q96MD7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf85Q96MD7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf85Q96MD7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf85Q96MD7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf85Q96MD7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf85Q96MD7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf85Q96MD7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf85Q96MD7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf85Q96MD7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf85Q96MD7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf85Q96MD7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf85Q96MD7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf85Q96MD7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf85Q96MD7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf85Q96MD7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf85Q96MD7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf85Q96MD7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf85Q96MD7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf85Q96MD7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C9orf85Q96MD7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C9orf85Q96MD7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C9orf85Q96MD7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf85Q96MD7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf85Q96MD7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf85Q96MD7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf85Q96MD7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf85Q96MD7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf85Q96MD7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf85Q96MD7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf85Q96MD7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf85Q96MD7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf85Q96MD7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf85Q96MD7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf85Q96MD7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf85Q96MD7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf85Q96MD7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf85Q96MD7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf85Q96MD7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf85Q96MD7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf85Q96MD7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf85Q96MD7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf85Q96MD7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf85Q96MD7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf85Q96MD7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf85Q96MD7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf85Q96MD7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf85Q96MD7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf85Q96MD7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf85Q96MD7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf85Q96MD7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf85Q96MD7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf85Q96MD7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf85Q96MD7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf85Q96MD7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf85Q96MD7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf85Q96MD7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf85Q96MD7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf85Q96MD7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf85Q96MD7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf85Q96MD7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf85Q96MD7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms