Protein–RNA interactions for Protein: Q96LJ8

UBXN10, UBX domain-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN10Q96LJ8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
UBXN10Q96LJ8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBXN10Q96LJ8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBXN10Q96LJ8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBXN10Q96LJ8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBXN10Q96LJ8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBXN10Q96LJ8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBXN10Q96LJ8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBXN10Q96LJ8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBXN10Q96LJ8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBXN10Q96LJ8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBXN10Q96LJ8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBXN10Q96LJ8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBXN10Q96LJ8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
UBXN10Q96LJ8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBXN10Q96LJ8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBXN10Q96LJ8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBXN10Q96LJ8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBXN10Q96LJ8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBXN10Q96LJ8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
UBXN10Q96LJ8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBXN10Q96LJ8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBXN10Q96LJ8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBXN10Q96LJ8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBXN10Q96LJ8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBXN10Q96LJ8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBXN10Q96LJ8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBXN10Q96LJ8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBXN10Q96LJ8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBXN10Q96LJ8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBXN10Q96LJ8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBXN10Q96LJ8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBXN10Q96LJ8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
UBXN10Q96LJ8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBXN10Q96LJ8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
UBXN10Q96LJ8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBXN10Q96LJ8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBXN10Q96LJ8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBXN10Q96LJ8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBXN10Q96LJ8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBXN10Q96LJ8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBXN10Q96LJ8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBXN10Q96LJ8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBXN10Q96LJ8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBXN10Q96LJ8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
UBXN10Q96LJ8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBXN10Q96LJ8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBXN10Q96LJ8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBXN10Q96LJ8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBXN10Q96LJ8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBXN10Q96LJ8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
UBXN10Q96LJ8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBXN10Q96LJ8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBXN10Q96LJ8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBXN10Q96LJ8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBXN10Q96LJ8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBXN10Q96LJ8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBXN10Q96LJ8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBXN10Q96LJ8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBXN10Q96LJ8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBXN10Q96LJ8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBXN10Q96LJ8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBXN10Q96LJ8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBXN10Q96LJ8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBXN10Q96LJ8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBXN10Q96LJ8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBXN10Q96LJ8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBXN10Q96LJ8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBXN10Q96LJ8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBXN10Q96LJ8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBXN10Q96LJ8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBXN10Q96LJ8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBXN10Q96LJ8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
UBXN10Q96LJ8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBXN10Q96LJ8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
UBXN10Q96LJ8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
UBXN10Q96LJ8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBXN10Q96LJ8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBXN10Q96LJ8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBXN10Q96LJ8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBXN10Q96LJ8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBXN10Q96LJ8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBXN10Q96LJ8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBXN10Q96LJ8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBXN10Q96LJ8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBXN10Q96LJ8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBXN10Q96LJ8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBXN10Q96LJ8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBXN10Q96LJ8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBXN10Q96LJ8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBXN10Q96LJ8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBXN10Q96LJ8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
UBXN10Q96LJ8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBXN10Q96LJ8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBXN10Q96LJ8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBXN10Q96LJ8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBXN10Q96LJ8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
UBXN10Q96LJ8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBXN10Q96LJ8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBXN10Q96LJ8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms