Protein–RNA interactions for Protein: Q96L94

SNX22, Sorting nexin-22, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX22Q96L94 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX22Q96L94 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX22Q96L94 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX22Q96L94 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX22Q96L94 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX22Q96L94 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX22Q96L94 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX22Q96L94 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX22Q96L94 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX22Q96L94 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX22Q96L94 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX22Q96L94 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX22Q96L94 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX22Q96L94 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX22Q96L94 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX22Q96L94 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX22Q96L94 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX22Q96L94 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX22Q96L94 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX22Q96L94 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX22Q96L94 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX22Q96L94 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX22Q96L94 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX22Q96L94 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX22Q96L94 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX22Q96L94 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX22Q96L94 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX22Q96L94 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX22Q96L94 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX22Q96L94 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX22Q96L94 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX22Q96L94 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX22Q96L94 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX22Q96L94 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX22Q96L94 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX22Q96L94 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX22Q96L94 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX22Q96L94 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX22Q96L94 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX22Q96L94 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX22Q96L94 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX22Q96L94 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX22Q96L94 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX22Q96L94 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX22Q96L94 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX22Q96L94 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX22Q96L94 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX22Q96L94 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX22Q96L94 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX22Q96L94 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX22Q96L94 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX22Q96L94 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX22Q96L94 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX22Q96L94 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX22Q96L94 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX22Q96L94 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX22Q96L94 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX22Q96L94 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX22Q96L94 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX22Q96L94 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX22Q96L94 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX22Q96L94 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX22Q96L94 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX22Q96L94 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX22Q96L94 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX22Q96L94 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX22Q96L94 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX22Q96L94 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX22Q96L94 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX22Q96L94 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX22Q96L94 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX22Q96L94 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX22Q96L94 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX22Q96L94 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX22Q96L94 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX22Q96L94 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX22Q96L94 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX22Q96L94 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX22Q96L94 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX22Q96L94 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX22Q96L94 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX22Q96L94 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX22Q96L94 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX22Q96L94 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX22Q96L94 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX22Q96L94 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX22Q96L94 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX22Q96L94 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX22Q96L94 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX22Q96L94 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX22Q96L94 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX22Q96L94 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX22Q96L94 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX22Q96L94 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX22Q96L94 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX22Q96L94 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX22Q96L94 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX22Q96L94 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX22Q96L94 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX22Q96L94 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms