Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
GJD4Q96KN9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
GJD4Q96KN9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
GJD4Q96KN9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
GJD4Q96KN9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
GJD4Q96KN9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
GJD4Q96KN9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
GJD4Q96KN9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
GJD4Q96KN9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
GJD4Q96KN9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
GJD4Q96KN9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
GJD4Q96KN9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
GJD4Q96KN9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
GJD4Q96KN9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
GJD4Q96KN9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
GJD4Q96KN9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
GJD4Q96KN9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
GJD4Q96KN9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
GJD4Q96KN9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
GJD4Q96KN9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
GJD4Q96KN9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
GJD4Q96KN9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
GJD4Q96KN9 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
GJD4Q96KN9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
GJD4Q96KN9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
GJD4Q96KN9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
GJD4Q96KN9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
GJD4Q96KN9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
GJD4Q96KN9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
GJD4Q96KN9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
GJD4Q96KN9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
GJD4Q96KN9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
GJD4Q96KN9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
GJD4Q96KN9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
GJD4Q96KN9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
GJD4Q96KN9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
GJD4Q96KN9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
GJD4Q96KN9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
GJD4Q96KN9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
GJD4Q96KN9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
GJD4Q96KN9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
GJD4Q96KN9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
GJD4Q96KN9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
GJD4Q96KN9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
GJD4Q96KN9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
GJD4Q96KN9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
GJD4Q96KN9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
GJD4Q96KN9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
GJD4Q96KN9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
GJD4Q96KN9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
GJD4Q96KN9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
GJD4Q96KN9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
GJD4Q96KN9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
GJD4Q96KN9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
GJD4Q96KN9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
GJD4Q96KN9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
GJD4Q96KN9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
GJD4Q96KN9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
GJD4Q96KN9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
GJD4Q96KN9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
GJD4Q96KN9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
GJD4Q96KN9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
GJD4Q96KN9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
GJD4Q96KN9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
GJD4Q96KN9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
GJD4Q96KN9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
GJD4Q96KN9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
GJD4Q96KN9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
GJD4Q96KN9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
GJD4Q96KN9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
GJD4Q96KN9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
GJD4Q96KN9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
GJD4Q96KN9 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
GJD4Q96KN9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
GJD4Q96KN9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
GJD4Q96KN9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
GJD4Q96KN9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
GJD4Q96KN9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
GJD4Q96KN9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
GJD4Q96KN9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
GJD4Q96KN9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
GJD4Q96KN9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
GJD4Q96KN9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
GJD4Q96KN9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
GJD4Q96KN9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
GJD4Q96KN9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
GJD4Q96KN9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
GJD4Q96KN9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
GJD4Q96KN9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC32.22■■■□□ 2.75
GJD4Q96KN9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
GJD4Q96KN9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
GJD4Q96KN9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
GJD4Q96KN9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
GJD4Q96KN9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
GJD4Q96KN9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
GJD4Q96KN9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
GJD4Q96KN9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
GJD4Q96KN9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
GJD4Q96KN9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
GJD4Q96KN9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms