Protein–RNA interactions for Protein: Q96KK3

KCNS1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS1Q96KK3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNS1Q96KK3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNS1Q96KK3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNS1Q96KK3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNS1Q96KK3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNS1Q96KK3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNS1Q96KK3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNS1Q96KK3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNS1Q96KK3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNS1Q96KK3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNS1Q96KK3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNS1Q96KK3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNS1Q96KK3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNS1Q96KK3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNS1Q96KK3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNS1Q96KK3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNS1Q96KK3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNS1Q96KK3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNS1Q96KK3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNS1Q96KK3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNS1Q96KK3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNS1Q96KK3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNS1Q96KK3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNS1Q96KK3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNS1Q96KK3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNS1Q96KK3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNS1Q96KK3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNS1Q96KK3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNS1Q96KK3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNS1Q96KK3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNS1Q96KK3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNS1Q96KK3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNS1Q96KK3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNS1Q96KK3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNS1Q96KK3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNS1Q96KK3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNS1Q96KK3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNS1Q96KK3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNS1Q96KK3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNS1Q96KK3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNS1Q96KK3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNS1Q96KK3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNS1Q96KK3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNS1Q96KK3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNS1Q96KK3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNS1Q96KK3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNS1Q96KK3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNS1Q96KK3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNS1Q96KK3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNS1Q96KK3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNS1Q96KK3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNS1Q96KK3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNS1Q96KK3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNS1Q96KK3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNS1Q96KK3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNS1Q96KK3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNS1Q96KK3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNS1Q96KK3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNS1Q96KK3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNS1Q96KK3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNS1Q96KK3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNS1Q96KK3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNS1Q96KK3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNS1Q96KK3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNS1Q96KK3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNS1Q96KK3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNS1Q96KK3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNS1Q96KK3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNS1Q96KK3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNS1Q96KK3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNS1Q96KK3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNS1Q96KK3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNS1Q96KK3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNS1Q96KK3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNS1Q96KK3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNS1Q96KK3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNS1Q96KK3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNS1Q96KK3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNS1Q96KK3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNS1Q96KK3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNS1Q96KK3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNS1Q96KK3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNS1Q96KK3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNS1Q96KK3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNS1Q96KK3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNS1Q96KK3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNS1Q96KK3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNS1Q96KK3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNS1Q96KK3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNS1Q96KK3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNS1Q96KK3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNS1Q96KK3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNS1Q96KK3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNS1Q96KK3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNS1Q96KK3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNS1Q96KK3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNS1Q96KK3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNS1Q96KK3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNS1Q96KK3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNS1Q96KK3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms