Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MS4A4AQ96JQ5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MS4A4AQ96JQ5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MS4A4AQ96JQ5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MS4A4AQ96JQ5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MS4A4AQ96JQ5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MS4A4AQ96JQ5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MS4A4AQ96JQ5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MS4A4AQ96JQ5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
MS4A4AQ96JQ5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MS4A4AQ96JQ5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MS4A4AQ96JQ5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MS4A4AQ96JQ5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MS4A4AQ96JQ5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MS4A4AQ96JQ5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MS4A4AQ96JQ5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MS4A4AQ96JQ5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MS4A4AQ96JQ5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MS4A4AQ96JQ5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MS4A4AQ96JQ5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MS4A4AQ96JQ5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MS4A4AQ96JQ5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MS4A4AQ96JQ5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MS4A4AQ96JQ5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MS4A4AQ96JQ5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MS4A4AQ96JQ5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MS4A4AQ96JQ5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MS4A4AQ96JQ5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MS4A4AQ96JQ5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MS4A4AQ96JQ5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MS4A4AQ96JQ5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MS4A4AQ96JQ5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MS4A4AQ96JQ5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MS4A4AQ96JQ5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MS4A4AQ96JQ5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MS4A4AQ96JQ5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MS4A4AQ96JQ5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
MS4A4AQ96JQ5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MS4A4AQ96JQ5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MS4A4AQ96JQ5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MS4A4AQ96JQ5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MS4A4AQ96JQ5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MS4A4AQ96JQ5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MS4A4AQ96JQ5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
MS4A4AQ96JQ5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
MS4A4AQ96JQ5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MS4A4AQ96JQ5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MS4A4AQ96JQ5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MS4A4AQ96JQ5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MS4A4AQ96JQ5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MS4A4AQ96JQ5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MS4A4AQ96JQ5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MS4A4AQ96JQ5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
MS4A4AQ96JQ5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MS4A4AQ96JQ5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MS4A4AQ96JQ5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MS4A4AQ96JQ5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MS4A4AQ96JQ5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MS4A4AQ96JQ5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MS4A4AQ96JQ5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MS4A4AQ96JQ5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MS4A4AQ96JQ5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MS4A4AQ96JQ5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MS4A4AQ96JQ5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
MS4A4AQ96JQ5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MS4A4AQ96JQ5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MS4A4AQ96JQ5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MS4A4AQ96JQ5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
MS4A4AQ96JQ5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MS4A4AQ96JQ5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MS4A4AQ96JQ5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MS4A4AQ96JQ5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MS4A4AQ96JQ5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MS4A4AQ96JQ5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MS4A4AQ96JQ5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MS4A4AQ96JQ5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MS4A4AQ96JQ5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MS4A4AQ96JQ5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MS4A4AQ96JQ5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
MS4A4AQ96JQ5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
MS4A4AQ96JQ5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MS4A4AQ96JQ5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MS4A4AQ96JQ5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MS4A4AQ96JQ5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MS4A4AQ96JQ5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MS4A4AQ96JQ5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MS4A4AQ96JQ5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MS4A4AQ96JQ5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MS4A4AQ96JQ5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MS4A4AQ96JQ5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MS4A4AQ96JQ5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MS4A4AQ96JQ5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
MS4A4AQ96JQ5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MS4A4AQ96JQ5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MS4A4AQ96JQ5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MS4A4AQ96JQ5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MS4A4AQ96JQ5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
MS4A4AQ96JQ5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MS4A4AQ96JQ5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
MS4A4AQ96JQ5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms