Protein–RNA interactions for Protein: Q96HH6

TMEM19, Transmembrane protein 19, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM19Q96HH6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM19Q96HH6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM19Q96HH6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM19Q96HH6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM19Q96HH6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM19Q96HH6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM19Q96HH6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM19Q96HH6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM19Q96HH6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM19Q96HH6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM19Q96HH6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM19Q96HH6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM19Q96HH6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM19Q96HH6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM19Q96HH6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM19Q96HH6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM19Q96HH6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM19Q96HH6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM19Q96HH6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM19Q96HH6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM19Q96HH6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM19Q96HH6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM19Q96HH6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM19Q96HH6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM19Q96HH6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM19Q96HH6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM19Q96HH6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM19Q96HH6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM19Q96HH6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM19Q96HH6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM19Q96HH6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM19Q96HH6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM19Q96HH6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM19Q96HH6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM19Q96HH6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM19Q96HH6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM19Q96HH6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM19Q96HH6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM19Q96HH6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM19Q96HH6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM19Q96HH6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM19Q96HH6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM19Q96HH6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM19Q96HH6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM19Q96HH6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM19Q96HH6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM19Q96HH6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM19Q96HH6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM19Q96HH6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM19Q96HH6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM19Q96HH6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM19Q96HH6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM19Q96HH6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM19Q96HH6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM19Q96HH6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM19Q96HH6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM19Q96HH6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM19Q96HH6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM19Q96HH6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM19Q96HH6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM19Q96HH6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM19Q96HH6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM19Q96HH6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM19Q96HH6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM19Q96HH6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM19Q96HH6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM19Q96HH6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM19Q96HH6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM19Q96HH6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM19Q96HH6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM19Q96HH6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM19Q96HH6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM19Q96HH6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM19Q96HH6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM19Q96HH6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM19Q96HH6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM19Q96HH6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM19Q96HH6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM19Q96HH6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM19Q96HH6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM19Q96HH6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM19Q96HH6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM19Q96HH6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM19Q96HH6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM19Q96HH6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM19Q96HH6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM19Q96HH6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM19Q96HH6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM19Q96HH6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM19Q96HH6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM19Q96HH6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM19Q96HH6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM19Q96HH6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM19Q96HH6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM19Q96HH6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM19Q96HH6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM19Q96HH6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM19Q96HH6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM19Q96HH6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM19Q96HH6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms