Protein–RNA interactions for Protein: Q96GR2

ACSBG1, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase ACSBG1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSBG1Q96GR2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
ACSBG1Q96GR2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
ACSBG1Q96GR2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC31.65■■■□□ 2.66
ACSBG1Q96GR2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
ACSBG1Q96GR2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
ACSBG1Q96GR2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
ACSBG1Q96GR2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
ACSBG1Q96GR2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
ACSBG1Q96GR2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
ACSBG1Q96GR2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
ACSBG1Q96GR2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
ACSBG1Q96GR2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
ACSBG1Q96GR2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
ACSBG1Q96GR2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
ACSBG1Q96GR2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
ACSBG1Q96GR2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
ACSBG1Q96GR2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
ACSBG1Q96GR2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
ACSBG1Q96GR2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
ACSBG1Q96GR2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ACSBG1Q96GR2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ACSBG1Q96GR2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ACSBG1Q96GR2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
ACSBG1Q96GR2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
ACSBG1Q96GR2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ACSBG1Q96GR2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ACSBG1Q96GR2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
ACSBG1Q96GR2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
ACSBG1Q96GR2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ACSBG1Q96GR2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ACSBG1Q96GR2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ACSBG1Q96GR2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ACSBG1Q96GR2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ACSBG1Q96GR2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ACSBG1Q96GR2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ACSBG1Q96GR2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ACSBG1Q96GR2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ACSBG1Q96GR2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ACSBG1Q96GR2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
ACSBG1Q96GR2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ACSBG1Q96GR2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ACSBG1Q96GR2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ACSBG1Q96GR2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ACSBG1Q96GR2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ACSBG1Q96GR2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ACSBG1Q96GR2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ACSBG1Q96GR2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ACSBG1Q96GR2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
ACSBG1Q96GR2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
ACSBG1Q96GR2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ACSBG1Q96GR2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ACSBG1Q96GR2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ACSBG1Q96GR2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
ACSBG1Q96GR2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
ACSBG1Q96GR2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ACSBG1Q96GR2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ACSBG1Q96GR2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
ACSBG1Q96GR2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
ACSBG1Q96GR2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
ACSBG1Q96GR2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
ACSBG1Q96GR2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
ACSBG1Q96GR2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
ACSBG1Q96GR2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
ACSBG1Q96GR2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
ACSBG1Q96GR2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC31.5■■■□□ 2.63
ACSBG1Q96GR2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ACSBG1Q96GR2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ACSBG1Q96GR2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ACSBG1Q96GR2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ACSBG1Q96GR2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ACSBG1Q96GR2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ACSBG1Q96GR2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ACSBG1Q96GR2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ACSBG1Q96GR2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ACSBG1Q96GR2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ACSBG1Q96GR2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
ACSBG1Q96GR2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
ACSBG1Q96GR2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
ACSBG1Q96GR2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
ACSBG1Q96GR2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
ACSBG1Q96GR2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
ACSBG1Q96GR2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
ACSBG1Q96GR2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
ACSBG1Q96GR2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
ACSBG1Q96GR2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
ACSBG1Q96GR2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
ACSBG1Q96GR2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ACSBG1Q96GR2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ACSBG1Q96GR2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ACSBG1Q96GR2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ACSBG1Q96GR2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
ACSBG1Q96GR2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ACSBG1Q96GR2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ACSBG1Q96GR2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ACSBG1Q96GR2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ACSBG1Q96GR2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
ACSBG1Q96GR2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
ACSBG1Q96GR2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
ACSBG1Q96GR2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
ACSBG1Q96GR2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms