Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
LTV1Q96GA3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
LTV1Q96GA3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
LTV1Q96GA3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
LTV1Q96GA3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
LTV1Q96GA3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
LTV1Q96GA3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
LTV1Q96GA3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
LTV1Q96GA3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
LTV1Q96GA3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
LTV1Q96GA3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
LTV1Q96GA3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
LTV1Q96GA3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
LTV1Q96GA3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
LTV1Q96GA3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
LTV1Q96GA3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
LTV1Q96GA3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
LTV1Q96GA3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
LTV1Q96GA3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
LTV1Q96GA3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
LTV1Q96GA3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
LTV1Q96GA3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
LTV1Q96GA3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
LTV1Q96GA3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
LTV1Q96GA3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
LTV1Q96GA3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
LTV1Q96GA3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
LTV1Q96GA3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
LTV1Q96GA3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
LTV1Q96GA3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
LTV1Q96GA3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
LTV1Q96GA3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
LTV1Q96GA3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
LTV1Q96GA3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
LTV1Q96GA3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
LTV1Q96GA3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
LTV1Q96GA3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
LTV1Q96GA3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
LTV1Q96GA3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
LTV1Q96GA3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
LTV1Q96GA3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
LTV1Q96GA3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
LTV1Q96GA3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
LTV1Q96GA3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
LTV1Q96GA3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
LTV1Q96GA3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
LTV1Q96GA3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
LTV1Q96GA3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
LTV1Q96GA3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
LTV1Q96GA3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
LTV1Q96GA3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
LTV1Q96GA3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
LTV1Q96GA3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
LTV1Q96GA3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
LTV1Q96GA3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
LTV1Q96GA3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
LTV1Q96GA3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
LTV1Q96GA3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
LTV1Q96GA3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
LTV1Q96GA3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
LTV1Q96GA3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC32.23■■■□□ 2.75
LTV1Q96GA3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
LTV1Q96GA3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
LTV1Q96GA3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
LTV1Q96GA3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
LTV1Q96GA3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
LTV1Q96GA3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
LTV1Q96GA3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
LTV1Q96GA3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
LTV1Q96GA3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
LTV1Q96GA3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
LTV1Q96GA3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
LTV1Q96GA3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
LTV1Q96GA3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
LTV1Q96GA3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
LTV1Q96GA3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
LTV1Q96GA3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
LTV1Q96GA3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
LTV1Q96GA3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
LTV1Q96GA3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
LTV1Q96GA3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
LTV1Q96GA3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
LTV1Q96GA3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
LTV1Q96GA3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
LTV1Q96GA3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
LTV1Q96GA3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
LTV1Q96GA3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
LTV1Q96GA3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
LTV1Q96GA3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
LTV1Q96GA3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
LTV1Q96GA3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
LTV1Q96GA3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
LTV1Q96GA3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC32.16■■■□□ 2.74
LTV1Q96GA3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
LTV1Q96GA3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
LTV1Q96GA3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
LTV1Q96GA3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
LTV1Q96GA3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
LTV1Q96GA3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
LTV1Q96GA3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms