Protein–RNA interactions for Protein: Q96FS4

SIPA1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1Q96FS4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIPA1Q96FS4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIPA1Q96FS4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIPA1Q96FS4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIPA1Q96FS4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIPA1Q96FS4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIPA1Q96FS4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIPA1Q96FS4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIPA1Q96FS4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIPA1Q96FS4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIPA1Q96FS4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SIPA1Q96FS4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SIPA1Q96FS4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SIPA1Q96FS4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SIPA1Q96FS4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIPA1Q96FS4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIPA1Q96FS4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIPA1Q96FS4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIPA1Q96FS4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIPA1Q96FS4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIPA1Q96FS4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIPA1Q96FS4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIPA1Q96FS4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIPA1Q96FS4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIPA1Q96FS4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIPA1Q96FS4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SIPA1Q96FS4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIPA1Q96FS4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIPA1Q96FS4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIPA1Q96FS4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIPA1Q96FS4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIPA1Q96FS4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIPA1Q96FS4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SIPA1Q96FS4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIPA1Q96FS4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SIPA1Q96FS4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SIPA1Q96FS4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SIPA1Q96FS4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIPA1Q96FS4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIPA1Q96FS4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIPA1Q96FS4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIPA1Q96FS4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIPA1Q96FS4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIPA1Q96FS4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIPA1Q96FS4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIPA1Q96FS4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SIPA1Q96FS4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIPA1Q96FS4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIPA1Q96FS4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIPA1Q96FS4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIPA1Q96FS4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIPA1Q96FS4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIPA1Q96FS4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SIPA1Q96FS4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIPA1Q96FS4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SIPA1Q96FS4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIPA1Q96FS4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIPA1Q96FS4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIPA1Q96FS4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIPA1Q96FS4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIPA1Q96FS4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIPA1Q96FS4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIPA1Q96FS4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIPA1Q96FS4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIPA1Q96FS4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIPA1Q96FS4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SIPA1Q96FS4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SIPA1Q96FS4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIPA1Q96FS4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIPA1Q96FS4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SIPA1Q96FS4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIPA1Q96FS4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIPA1Q96FS4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIPA1Q96FS4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIPA1Q96FS4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIPA1Q96FS4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIPA1Q96FS4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SIPA1Q96FS4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIPA1Q96FS4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIPA1Q96FS4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIPA1Q96FS4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIPA1Q96FS4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIPA1Q96FS4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIPA1Q96FS4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIPA1Q96FS4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIPA1Q96FS4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIPA1Q96FS4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIPA1Q96FS4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIPA1Q96FS4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIPA1Q96FS4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIPA1Q96FS4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIPA1Q96FS4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIPA1Q96FS4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIPA1Q96FS4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIPA1Q96FS4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIPA1Q96FS4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIPA1Q96FS4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIPA1Q96FS4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIPA1Q96FS4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIPA1Q96FS4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms