Protein–RNA interactions for Protein: Q96FC9

DDX11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX11Q96FC9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
DDX11Q96FC9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DDX11Q96FC9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DDX11Q96FC9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DDX11Q96FC9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
DDX11Q96FC9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDX11Q96FC9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDX11Q96FC9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDX11Q96FC9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDX11Q96FC9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDX11Q96FC9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDX11Q96FC9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDX11Q96FC9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDX11Q96FC9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
DDX11Q96FC9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
DDX11Q96FC9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
DDX11Q96FC9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
DDX11Q96FC9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
DDX11Q96FC9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DDX11Q96FC9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DDX11Q96FC9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DDX11Q96FC9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DDX11Q96FC9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DDX11Q96FC9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDX11Q96FC9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDX11Q96FC9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDX11Q96FC9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDX11Q96FC9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDX11Q96FC9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDX11Q96FC9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDX11Q96FC9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDX11Q96FC9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDX11Q96FC9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDX11Q96FC9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDX11Q96FC9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDX11Q96FC9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDX11Q96FC9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDX11Q96FC9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDX11Q96FC9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDX11Q96FC9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDX11Q96FC9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDX11Q96FC9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDX11Q96FC9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDX11Q96FC9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDX11Q96FC9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DDX11Q96FC9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DDX11Q96FC9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DDX11Q96FC9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
DDX11Q96FC9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DDX11Q96FC9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DDX11Q96FC9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DDX11Q96FC9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DDX11Q96FC9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DDX11Q96FC9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DDX11Q96FC9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DDX11Q96FC9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DDX11Q96FC9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DDX11Q96FC9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDX11Q96FC9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
DDX11Q96FC9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDX11Q96FC9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
DDX11Q96FC9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDX11Q96FC9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDX11Q96FC9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDX11Q96FC9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDX11Q96FC9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDX11Q96FC9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDX11Q96FC9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDX11Q96FC9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDX11Q96FC9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDX11Q96FC9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDX11Q96FC9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDX11Q96FC9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDX11Q96FC9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDX11Q96FC9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDX11Q96FC9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDX11Q96FC9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
DDX11Q96FC9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDX11Q96FC9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDX11Q96FC9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDX11Q96FC9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDX11Q96FC9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
DDX11Q96FC9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DDX11Q96FC9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DDX11Q96FC9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
DDX11Q96FC9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDX11Q96FC9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDX11Q96FC9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDX11Q96FC9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDX11Q96FC9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDX11Q96FC9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDX11Q96FC9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDX11Q96FC9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDX11Q96FC9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDX11Q96FC9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDX11Q96FC9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDX11Q96FC9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DDX11Q96FC9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DDX11Q96FC9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DDX11Q96FC9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms