Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNFT2Q96EX2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNFT2Q96EX2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNFT2Q96EX2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNFT2Q96EX2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNFT2Q96EX2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNFT2Q96EX2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNFT2Q96EX2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNFT2Q96EX2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNFT2Q96EX2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNFT2Q96EX2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNFT2Q96EX2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNFT2Q96EX2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNFT2Q96EX2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNFT2Q96EX2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNFT2Q96EX2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNFT2Q96EX2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNFT2Q96EX2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNFT2Q96EX2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNFT2Q96EX2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNFT2Q96EX2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNFT2Q96EX2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNFT2Q96EX2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNFT2Q96EX2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNFT2Q96EX2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNFT2Q96EX2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNFT2Q96EX2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNFT2Q96EX2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNFT2Q96EX2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNFT2Q96EX2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNFT2Q96EX2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNFT2Q96EX2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNFT2Q96EX2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNFT2Q96EX2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RNFT2Q96EX2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RNFT2Q96EX2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNFT2Q96EX2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNFT2Q96EX2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNFT2Q96EX2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNFT2Q96EX2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNFT2Q96EX2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNFT2Q96EX2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RNFT2Q96EX2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNFT2Q96EX2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNFT2Q96EX2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNFT2Q96EX2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNFT2Q96EX2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNFT2Q96EX2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNFT2Q96EX2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNFT2Q96EX2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RNFT2Q96EX2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNFT2Q96EX2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNFT2Q96EX2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNFT2Q96EX2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNFT2Q96EX2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNFT2Q96EX2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNFT2Q96EX2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNFT2Q96EX2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNFT2Q96EX2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNFT2Q96EX2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNFT2Q96EX2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNFT2Q96EX2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNFT2Q96EX2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNFT2Q96EX2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNFT2Q96EX2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNFT2Q96EX2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNFT2Q96EX2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNFT2Q96EX2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNFT2Q96EX2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNFT2Q96EX2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNFT2Q96EX2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNFT2Q96EX2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNFT2Q96EX2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNFT2Q96EX2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNFT2Q96EX2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNFT2Q96EX2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNFT2Q96EX2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNFT2Q96EX2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RNFT2Q96EX2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNFT2Q96EX2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNFT2Q96EX2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNFT2Q96EX2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNFT2Q96EX2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNFT2Q96EX2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNFT2Q96EX2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNFT2Q96EX2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNFT2Q96EX2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNFT2Q96EX2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNFT2Q96EX2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNFT2Q96EX2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNFT2Q96EX2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNFT2Q96EX2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNFT2Q96EX2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNFT2Q96EX2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNFT2Q96EX2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNFT2Q96EX2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNFT2Q96EX2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNFT2Q96EX2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNFT2Q96EX2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNFT2Q96EX2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms