Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MTERF3Q96E29 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MTERF3Q96E29 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTERF3Q96E29 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTERF3Q96E29 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTERF3Q96E29 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTERF3Q96E29 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTERF3Q96E29 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTERF3Q96E29 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTERF3Q96E29 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTERF3Q96E29 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTERF3Q96E29 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTERF3Q96E29 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTERF3Q96E29 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTERF3Q96E29 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTERF3Q96E29 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTERF3Q96E29 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTERF3Q96E29 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTERF3Q96E29 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MTERF3Q96E29 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MTERF3Q96E29 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTERF3Q96E29 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTERF3Q96E29 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTERF3Q96E29 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTERF3Q96E29 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTERF3Q96E29 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTERF3Q96E29 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTERF3Q96E29 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MTERF3Q96E29 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTERF3Q96E29 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTERF3Q96E29 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTERF3Q96E29 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTERF3Q96E29 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTERF3Q96E29 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTERF3Q96E29 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTERF3Q96E29 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTERF3Q96E29 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTERF3Q96E29 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTERF3Q96E29 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTERF3Q96E29 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MTERF3Q96E29 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTERF3Q96E29 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTERF3Q96E29 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTERF3Q96E29 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTERF3Q96E29 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTERF3Q96E29 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTERF3Q96E29 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTERF3Q96E29 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MTERF3Q96E29 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTERF3Q96E29 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTERF3Q96E29 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTERF3Q96E29 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MTERF3Q96E29 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTERF3Q96E29 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTERF3Q96E29 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTERF3Q96E29 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTERF3Q96E29 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTERF3Q96E29 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTERF3Q96E29 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTERF3Q96E29 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTERF3Q96E29 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTERF3Q96E29 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTERF3Q96E29 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTERF3Q96E29 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTERF3Q96E29 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTERF3Q96E29 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MTERF3Q96E29 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTERF3Q96E29 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTERF3Q96E29 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTERF3Q96E29 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTERF3Q96E29 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTERF3Q96E29 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTERF3Q96E29 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTERF3Q96E29 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTERF3Q96E29 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTERF3Q96E29 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTERF3Q96E29 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTERF3Q96E29 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTERF3Q96E29 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MTERF3Q96E29 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MTERF3Q96E29 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTERF3Q96E29 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTERF3Q96E29 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTERF3Q96E29 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTERF3Q96E29 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTERF3Q96E29 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTERF3Q96E29 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTERF3Q96E29 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTERF3Q96E29 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTERF3Q96E29 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTERF3Q96E29 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTERF3Q96E29 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTERF3Q96E29 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTERF3Q96E29 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTERF3Q96E29 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTERF3Q96E29 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTERF3Q96E29 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTERF3Q96E29 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTERF3Q96E29 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTERF3Q96E29 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms