Protein–RNA interactions for Protein: Q96E22

NUS1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit NUS1, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUS1Q96E22 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUS1Q96E22 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUS1Q96E22 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUS1Q96E22 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUS1Q96E22 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUS1Q96E22 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUS1Q96E22 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUS1Q96E22 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUS1Q96E22 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUS1Q96E22 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUS1Q96E22 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NUS1Q96E22 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NUS1Q96E22 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUS1Q96E22 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUS1Q96E22 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUS1Q96E22 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUS1Q96E22 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUS1Q96E22 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NUS1Q96E22 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUS1Q96E22 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NUS1Q96E22 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUS1Q96E22 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUS1Q96E22 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUS1Q96E22 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUS1Q96E22 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NUS1Q96E22 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUS1Q96E22 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUS1Q96E22 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUS1Q96E22 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUS1Q96E22 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUS1Q96E22 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUS1Q96E22 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUS1Q96E22 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUS1Q96E22 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUS1Q96E22 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUS1Q96E22 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUS1Q96E22 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUS1Q96E22 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUS1Q96E22 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUS1Q96E22 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUS1Q96E22 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUS1Q96E22 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NUS1Q96E22 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NUS1Q96E22 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUS1Q96E22 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUS1Q96E22 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUS1Q96E22 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUS1Q96E22 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUS1Q96E22 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUS1Q96E22 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUS1Q96E22 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUS1Q96E22 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUS1Q96E22 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUS1Q96E22 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUS1Q96E22 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUS1Q96E22 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUS1Q96E22 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUS1Q96E22 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUS1Q96E22 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUS1Q96E22 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUS1Q96E22 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUS1Q96E22 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUS1Q96E22 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUS1Q96E22 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUS1Q96E22 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NUS1Q96E22 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUS1Q96E22 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NUS1Q96E22 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUS1Q96E22 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUS1Q96E22 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUS1Q96E22 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUS1Q96E22 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUS1Q96E22 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUS1Q96E22 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUS1Q96E22 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUS1Q96E22 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NUS1Q96E22 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUS1Q96E22 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUS1Q96E22 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUS1Q96E22 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUS1Q96E22 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUS1Q96E22 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUS1Q96E22 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NUS1Q96E22 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUS1Q96E22 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUS1Q96E22 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUS1Q96E22 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUS1Q96E22 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUS1Q96E22 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUS1Q96E22 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NUS1Q96E22 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUS1Q96E22 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUS1Q96E22 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUS1Q96E22 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NUS1Q96E22 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUS1Q96E22 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUS1Q96E22 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NUS1Q96E22 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUS1Q96E22 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUS1Q96E22 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms