Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RTP4Q96DX8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTP4Q96DX8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTP4Q96DX8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTP4Q96DX8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTP4Q96DX8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RTP4Q96DX8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTP4Q96DX8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTP4Q96DX8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTP4Q96DX8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTP4Q96DX8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTP4Q96DX8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTP4Q96DX8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTP4Q96DX8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTP4Q96DX8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTP4Q96DX8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTP4Q96DX8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTP4Q96DX8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTP4Q96DX8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTP4Q96DX8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTP4Q96DX8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RTP4Q96DX8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTP4Q96DX8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTP4Q96DX8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTP4Q96DX8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTP4Q96DX8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTP4Q96DX8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTP4Q96DX8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTP4Q96DX8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RTP4Q96DX8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RTP4Q96DX8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RTP4Q96DX8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RTP4Q96DX8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTP4Q96DX8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTP4Q96DX8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTP4Q96DX8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RTP4Q96DX8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTP4Q96DX8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTP4Q96DX8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTP4Q96DX8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTP4Q96DX8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTP4Q96DX8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTP4Q96DX8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTP4Q96DX8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTP4Q96DX8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTP4Q96DX8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTP4Q96DX8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RTP4Q96DX8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RTP4Q96DX8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RTP4Q96DX8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTP4Q96DX8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTP4Q96DX8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTP4Q96DX8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTP4Q96DX8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTP4Q96DX8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTP4Q96DX8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTP4Q96DX8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTP4Q96DX8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTP4Q96DX8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTP4Q96DX8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTP4Q96DX8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RTP4Q96DX8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTP4Q96DX8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTP4Q96DX8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTP4Q96DX8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RTP4Q96DX8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTP4Q96DX8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTP4Q96DX8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RTP4Q96DX8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTP4Q96DX8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTP4Q96DX8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTP4Q96DX8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTP4Q96DX8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTP4Q96DX8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTP4Q96DX8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTP4Q96DX8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTP4Q96DX8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTP4Q96DX8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTP4Q96DX8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTP4Q96DX8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTP4Q96DX8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTP4Q96DX8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTP4Q96DX8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTP4Q96DX8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTP4Q96DX8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTP4Q96DX8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTP4Q96DX8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTP4Q96DX8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RTP4Q96DX8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTP4Q96DX8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTP4Q96DX8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTP4Q96DX8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTP4Q96DX8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTP4Q96DX8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTP4Q96DX8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTP4Q96DX8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTP4Q96DX8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTP4Q96DX8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTP4Q96DX8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTP4Q96DX8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms