Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C18orf8Q96DM3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
C18orf8Q96DM3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C18orf8Q96DM3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C18orf8Q96DM3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C18orf8Q96DM3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
C18orf8Q96DM3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C18orf8Q96DM3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
C18orf8Q96DM3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
C18orf8Q96DM3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C18orf8Q96DM3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
C18orf8Q96DM3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C18orf8Q96DM3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
C18orf8Q96DM3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C18orf8Q96DM3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
C18orf8Q96DM3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C18orf8Q96DM3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C18orf8Q96DM3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C18orf8Q96DM3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C18orf8Q96DM3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
C18orf8Q96DM3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
C18orf8Q96DM3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C18orf8Q96DM3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C18orf8Q96DM3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C18orf8Q96DM3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C18orf8Q96DM3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C18orf8Q96DM3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C18orf8Q96DM3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C18orf8Q96DM3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C18orf8Q96DM3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
C18orf8Q96DM3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
C18orf8Q96DM3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C18orf8Q96DM3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C18orf8Q96DM3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C18orf8Q96DM3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C18orf8Q96DM3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C18orf8Q96DM3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C18orf8Q96DM3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C18orf8Q96DM3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C18orf8Q96DM3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C18orf8Q96DM3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C18orf8Q96DM3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C18orf8Q96DM3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C18orf8Q96DM3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C18orf8Q96DM3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C18orf8Q96DM3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C18orf8Q96DM3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C18orf8Q96DM3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C18orf8Q96DM3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C18orf8Q96DM3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C18orf8Q96DM3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C18orf8Q96DM3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C18orf8Q96DM3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C18orf8Q96DM3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
C18orf8Q96DM3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C18orf8Q96DM3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
C18orf8Q96DM3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
C18orf8Q96DM3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C18orf8Q96DM3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C18orf8Q96DM3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C18orf8Q96DM3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C18orf8Q96DM3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C18orf8Q96DM3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C18orf8Q96DM3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C18orf8Q96DM3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C18orf8Q96DM3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C18orf8Q96DM3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C18orf8Q96DM3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C18orf8Q96DM3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C18orf8Q96DM3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C18orf8Q96DM3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
C18orf8Q96DM3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C18orf8Q96DM3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C18orf8Q96DM3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
C18orf8Q96DM3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
C18orf8Q96DM3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C18orf8Q96DM3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C18orf8Q96DM3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C18orf8Q96DM3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C18orf8Q96DM3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C18orf8Q96DM3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C18orf8Q96DM3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C18orf8Q96DM3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C18orf8Q96DM3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C18orf8Q96DM3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C18orf8Q96DM3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C18orf8Q96DM3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C18orf8Q96DM3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
C18orf8Q96DM3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C18orf8Q96DM3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C18orf8Q96DM3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C18orf8Q96DM3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C18orf8Q96DM3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C18orf8Q96DM3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
C18orf8Q96DM3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C18orf8Q96DM3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C18orf8Q96DM3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C18orf8Q96DM3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C18orf8Q96DM3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C18orf8Q96DM3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms