Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB5

RMDN1, Regulator of microtubule dynamics protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN1Q96DB5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RMDN1Q96DB5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RMDN1Q96DB5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RMDN1Q96DB5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RMDN1Q96DB5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RMDN1Q96DB5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RMDN1Q96DB5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RMDN1Q96DB5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RMDN1Q96DB5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RMDN1Q96DB5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RMDN1Q96DB5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RMDN1Q96DB5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RMDN1Q96DB5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RMDN1Q96DB5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RMDN1Q96DB5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RMDN1Q96DB5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RMDN1Q96DB5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RMDN1Q96DB5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RMDN1Q96DB5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RMDN1Q96DB5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RMDN1Q96DB5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RMDN1Q96DB5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RMDN1Q96DB5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RMDN1Q96DB5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RMDN1Q96DB5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RMDN1Q96DB5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RMDN1Q96DB5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RMDN1Q96DB5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RMDN1Q96DB5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RMDN1Q96DB5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RMDN1Q96DB5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RMDN1Q96DB5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RMDN1Q96DB5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RMDN1Q96DB5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RMDN1Q96DB5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RMDN1Q96DB5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RMDN1Q96DB5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RMDN1Q96DB5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RMDN1Q96DB5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RMDN1Q96DB5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RMDN1Q96DB5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RMDN1Q96DB5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RMDN1Q96DB5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RMDN1Q96DB5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RMDN1Q96DB5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RMDN1Q96DB5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RMDN1Q96DB5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RMDN1Q96DB5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RMDN1Q96DB5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RMDN1Q96DB5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RMDN1Q96DB5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RMDN1Q96DB5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RMDN1Q96DB5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RMDN1Q96DB5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RMDN1Q96DB5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RMDN1Q96DB5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RMDN1Q96DB5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RMDN1Q96DB5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RMDN1Q96DB5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RMDN1Q96DB5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RMDN1Q96DB5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RMDN1Q96DB5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RMDN1Q96DB5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RMDN1Q96DB5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RMDN1Q96DB5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RMDN1Q96DB5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RMDN1Q96DB5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RMDN1Q96DB5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RMDN1Q96DB5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RMDN1Q96DB5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RMDN1Q96DB5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RMDN1Q96DB5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RMDN1Q96DB5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RMDN1Q96DB5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RMDN1Q96DB5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RMDN1Q96DB5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RMDN1Q96DB5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RMDN1Q96DB5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RMDN1Q96DB5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RMDN1Q96DB5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RMDN1Q96DB5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RMDN1Q96DB5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RMDN1Q96DB5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RMDN1Q96DB5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RMDN1Q96DB5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RMDN1Q96DB5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RMDN1Q96DB5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RMDN1Q96DB5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RMDN1Q96DB5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RMDN1Q96DB5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RMDN1Q96DB5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RMDN1Q96DB5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RMDN1Q96DB5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RMDN1Q96DB5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RMDN1Q96DB5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RMDN1Q96DB5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RMDN1Q96DB5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RMDN1Q96DB5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RMDN1Q96DB5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RMDN1Q96DB5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.7 ms