Protein–RNA interactions for Protein: Q96CV9

OPTN, Optineurin, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTNQ96CV9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
OPTNQ96CV9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
OPTNQ96CV9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
OPTNQ96CV9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
OPTNQ96CV9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
OPTNQ96CV9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
OPTNQ96CV9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
OPTNQ96CV9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
OPTNQ96CV9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
OPTNQ96CV9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
OPTNQ96CV9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
OPTNQ96CV9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
OPTNQ96CV9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
OPTNQ96CV9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
OPTNQ96CV9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
OPTNQ96CV9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
OPTNQ96CV9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
OPTNQ96CV9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
OPTNQ96CV9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
OPTNQ96CV9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
OPTNQ96CV9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
OPTNQ96CV9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
OPTNQ96CV9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
OPTNQ96CV9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
OPTNQ96CV9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
OPTNQ96CV9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
OPTNQ96CV9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
OPTNQ96CV9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
OPTNQ96CV9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
OPTNQ96CV9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
OPTNQ96CV9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
OPTNQ96CV9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
OPTNQ96CV9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
OPTNQ96CV9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
OPTNQ96CV9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
OPTNQ96CV9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
OPTNQ96CV9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
OPTNQ96CV9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
OPTNQ96CV9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
OPTNQ96CV9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
OPTNQ96CV9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
OPTNQ96CV9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
OPTNQ96CV9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
OPTNQ96CV9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
OPTNQ96CV9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
OPTNQ96CV9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
OPTNQ96CV9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
OPTNQ96CV9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
OPTNQ96CV9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
OPTNQ96CV9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
OPTNQ96CV9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
OPTNQ96CV9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
OPTNQ96CV9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
OPTNQ96CV9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
OPTNQ96CV9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
OPTNQ96CV9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
OPTNQ96CV9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
OPTNQ96CV9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
OPTNQ96CV9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
OPTNQ96CV9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
OPTNQ96CV9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
OPTNQ96CV9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
OPTNQ96CV9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
OPTNQ96CV9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
OPTNQ96CV9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
OPTNQ96CV9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
OPTNQ96CV9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
OPTNQ96CV9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
OPTNQ96CV9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
OPTNQ96CV9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
OPTNQ96CV9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
OPTNQ96CV9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
OPTNQ96CV9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
OPTNQ96CV9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
OPTNQ96CV9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
OPTNQ96CV9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
OPTNQ96CV9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
OPTNQ96CV9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
OPTNQ96CV9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
OPTNQ96CV9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
OPTNQ96CV9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
OPTNQ96CV9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
OPTNQ96CV9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
OPTNQ96CV9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
OPTNQ96CV9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
OPTNQ96CV9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
OPTNQ96CV9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
OPTNQ96CV9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
OPTNQ96CV9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
OPTNQ96CV9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
OPTNQ96CV9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
OPTNQ96CV9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
OPTNQ96CV9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
OPTNQ96CV9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
OPTNQ96CV9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
OPTNQ96CV9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
OPTNQ96CV9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
OPTNQ96CV9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
OPTNQ96CV9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
OPTNQ96CV9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms