Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG8

CTHRC1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTHRC1Q96CG8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTHRC1Q96CG8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTHRC1Q96CG8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTHRC1Q96CG8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CTHRC1Q96CG8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CTHRC1Q96CG8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTHRC1Q96CG8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTHRC1Q96CG8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTHRC1Q96CG8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTHRC1Q96CG8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTHRC1Q96CG8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTHRC1Q96CG8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTHRC1Q96CG8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTHRC1Q96CG8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTHRC1Q96CG8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTHRC1Q96CG8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTHRC1Q96CG8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTHRC1Q96CG8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTHRC1Q96CG8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTHRC1Q96CG8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CTHRC1Q96CG8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTHRC1Q96CG8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTHRC1Q96CG8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTHRC1Q96CG8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTHRC1Q96CG8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTHRC1Q96CG8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTHRC1Q96CG8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTHRC1Q96CG8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTHRC1Q96CG8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTHRC1Q96CG8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTHRC1Q96CG8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTHRC1Q96CG8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTHRC1Q96CG8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTHRC1Q96CG8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTHRC1Q96CG8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTHRC1Q96CG8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTHRC1Q96CG8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTHRC1Q96CG8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTHRC1Q96CG8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTHRC1Q96CG8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTHRC1Q96CG8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTHRC1Q96CG8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTHRC1Q96CG8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTHRC1Q96CG8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTHRC1Q96CG8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTHRC1Q96CG8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTHRC1Q96CG8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CTHRC1Q96CG8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTHRC1Q96CG8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTHRC1Q96CG8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTHRC1Q96CG8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTHRC1Q96CG8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTHRC1Q96CG8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTHRC1Q96CG8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTHRC1Q96CG8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTHRC1Q96CG8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTHRC1Q96CG8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CTHRC1Q96CG8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTHRC1Q96CG8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTHRC1Q96CG8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTHRC1Q96CG8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CTHRC1Q96CG8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTHRC1Q96CG8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTHRC1Q96CG8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CTHRC1Q96CG8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTHRC1Q96CG8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTHRC1Q96CG8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTHRC1Q96CG8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTHRC1Q96CG8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTHRC1Q96CG8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CTHRC1Q96CG8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTHRC1Q96CG8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CTHRC1Q96CG8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTHRC1Q96CG8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTHRC1Q96CG8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTHRC1Q96CG8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTHRC1Q96CG8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTHRC1Q96CG8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTHRC1Q96CG8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTHRC1Q96CG8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTHRC1Q96CG8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTHRC1Q96CG8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTHRC1Q96CG8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTHRC1Q96CG8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTHRC1Q96CG8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTHRC1Q96CG8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTHRC1Q96CG8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTHRC1Q96CG8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTHRC1Q96CG8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTHRC1Q96CG8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTHRC1Q96CG8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTHRC1Q96CG8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CTHRC1Q96CG8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTHRC1Q96CG8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTHRC1Q96CG8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTHRC1Q96CG8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTHRC1Q96CG8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTHRC1Q96CG8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTHRC1Q96CG8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CTHRC1Q96CG8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms