Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ5

CCDC127, Coiled-coil domain-containing protein 127, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC127Q96BQ5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC127Q96BQ5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC127Q96BQ5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC127Q96BQ5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC127Q96BQ5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC127Q96BQ5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC127Q96BQ5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC127Q96BQ5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC127Q96BQ5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC127Q96BQ5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC127Q96BQ5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC127Q96BQ5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC127Q96BQ5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC127Q96BQ5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC127Q96BQ5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC127Q96BQ5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC127Q96BQ5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC127Q96BQ5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC127Q96BQ5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC127Q96BQ5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC127Q96BQ5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC127Q96BQ5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC127Q96BQ5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC127Q96BQ5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC127Q96BQ5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC127Q96BQ5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC127Q96BQ5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC127Q96BQ5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC127Q96BQ5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC127Q96BQ5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC127Q96BQ5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC127Q96BQ5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC127Q96BQ5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC127Q96BQ5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC127Q96BQ5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC127Q96BQ5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC127Q96BQ5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC127Q96BQ5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC127Q96BQ5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC127Q96BQ5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC127Q96BQ5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC127Q96BQ5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC127Q96BQ5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC127Q96BQ5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC127Q96BQ5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC127Q96BQ5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC127Q96BQ5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC127Q96BQ5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC127Q96BQ5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC127Q96BQ5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC127Q96BQ5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC127Q96BQ5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC127Q96BQ5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC127Q96BQ5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC127Q96BQ5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC127Q96BQ5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCDC127Q96BQ5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC127Q96BQ5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC127Q96BQ5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC127Q96BQ5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC127Q96BQ5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC127Q96BQ5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC127Q96BQ5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC127Q96BQ5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC127Q96BQ5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC127Q96BQ5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC127Q96BQ5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC127Q96BQ5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC127Q96BQ5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC127Q96BQ5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC127Q96BQ5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC127Q96BQ5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC127Q96BQ5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC127Q96BQ5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC127Q96BQ5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC127Q96BQ5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC127Q96BQ5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC127Q96BQ5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC127Q96BQ5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC127Q96BQ5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC127Q96BQ5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC127Q96BQ5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC127Q96BQ5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC127Q96BQ5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC127Q96BQ5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC127Q96BQ5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC127Q96BQ5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC127Q96BQ5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC127Q96BQ5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC127Q96BQ5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC127Q96BQ5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC127Q96BQ5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC127Q96BQ5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC127Q96BQ5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC127Q96BQ5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC127Q96BQ5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CCDC127Q96BQ5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC127Q96BQ5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC127Q96BQ5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC127Q96BQ5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms