Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMARCE1Q969G3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCE1Q969G3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCE1Q969G3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCE1Q969G3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCE1Q969G3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCE1Q969G3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCE1Q969G3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCE1Q969G3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCE1Q969G3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCE1Q969G3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCE1Q969G3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMARCE1Q969G3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMARCE1Q969G3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMARCE1Q969G3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMARCE1Q969G3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMARCE1Q969G3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMARCE1Q969G3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMARCE1Q969G3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMARCE1Q969G3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMARCE1Q969G3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMARCE1Q969G3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMARCE1Q969G3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMARCE1Q969G3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMARCE1Q969G3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMARCE1Q969G3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMARCE1Q969G3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMARCE1Q969G3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMARCE1Q969G3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SMARCE1Q969G3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMARCE1Q969G3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMARCE1Q969G3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMARCE1Q969G3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMARCE1Q969G3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMARCE1Q969G3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMARCE1Q969G3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMARCE1Q969G3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMARCE1Q969G3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMARCE1Q969G3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMARCE1Q969G3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMARCE1Q969G3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SMARCE1Q969G3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMARCE1Q969G3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMARCE1Q969G3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMARCE1Q969G3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMARCE1Q969G3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMARCE1Q969G3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SMARCE1Q969G3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMARCE1Q969G3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMARCE1Q969G3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMARCE1Q969G3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMARCE1Q969G3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMARCE1Q969G3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMARCE1Q969G3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMARCE1Q969G3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMARCE1Q969G3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMARCE1Q969G3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMARCE1Q969G3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMARCE1Q969G3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMARCE1Q969G3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMARCE1Q969G3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMARCE1Q969G3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMARCE1Q969G3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMARCE1Q969G3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMARCE1Q969G3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMARCE1Q969G3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMARCE1Q969G3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SMARCE1Q969G3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMARCE1Q969G3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMARCE1Q969G3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCE1Q969G3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCE1Q969G3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCE1Q969G3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCE1Q969G3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCE1Q969G3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCE1Q969G3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCE1Q969G3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCE1Q969G3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCE1Q969G3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCE1Q969G3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCE1Q969G3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCE1Q969G3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCE1Q969G3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCE1Q969G3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCE1Q969G3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCE1Q969G3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCE1Q969G3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCE1Q969G3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCE1Q969G3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCE1Q969G3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCE1Q969G3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCE1Q969G3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCE1Q969G3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SMARCE1Q969G3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMARCE1Q969G3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMARCE1Q969G3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMARCE1Q969G3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMARCE1Q969G3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMARCE1Q969G3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMARCE1Q969G3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms