Protein–RNA interactions for Protein: Q93038

TNFRSF25, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 25, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25Q93038 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TNFRSF25Q93038 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TNFRSF25Q93038 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNFRSF25Q93038 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TNFRSF25Q93038 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TNFRSF25Q93038 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNFRSF25Q93038 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNFRSF25Q93038 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNFRSF25Q93038 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNFRSF25Q93038 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNFRSF25Q93038 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNFRSF25Q93038 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNFRSF25Q93038 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNFRSF25Q93038 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNFRSF25Q93038 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNFRSF25Q93038 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNFRSF25Q93038 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNFRSF25Q93038 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNFRSF25Q93038 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNFRSF25Q93038 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNFRSF25Q93038 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TNFRSF25Q93038 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNFRSF25Q93038 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNFRSF25Q93038 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNFRSF25Q93038 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNFRSF25Q93038 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNFRSF25Q93038 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNFRSF25Q93038 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNFRSF25Q93038 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNFRSF25Q93038 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNFRSF25Q93038 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNFRSF25Q93038 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNFRSF25Q93038 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNFRSF25Q93038 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNFRSF25Q93038 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TNFRSF25Q93038 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNFRSF25Q93038 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNFRSF25Q93038 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNFRSF25Q93038 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNFRSF25Q93038 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TNFRSF25Q93038 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TNFRSF25Q93038 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TNFRSF25Q93038 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNFRSF25Q93038 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNFRSF25Q93038 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNFRSF25Q93038 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNFRSF25Q93038 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNFRSF25Q93038 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TNFRSF25Q93038 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNFRSF25Q93038 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNFRSF25Q93038 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNFRSF25Q93038 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNFRSF25Q93038 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNFRSF25Q93038 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TNFRSF25Q93038 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNFRSF25Q93038 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNFRSF25Q93038 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNFRSF25Q93038 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNFRSF25Q93038 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNFRSF25Q93038 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNFRSF25Q93038 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNFRSF25Q93038 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNFRSF25Q93038 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNFRSF25Q93038 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNFRSF25Q93038 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNFRSF25Q93038 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNFRSF25Q93038 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNFRSF25Q93038 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNFRSF25Q93038 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNFRSF25Q93038 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TNFRSF25Q93038 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNFRSF25Q93038 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNFRSF25Q93038 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNFRSF25Q93038 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNFRSF25Q93038 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNFRSF25Q93038 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNFRSF25Q93038 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNFRSF25Q93038 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNFRSF25Q93038 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNFRSF25Q93038 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNFRSF25Q93038 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNFRSF25Q93038 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNFRSF25Q93038 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNFRSF25Q93038 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TNFRSF25Q93038 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNFRSF25Q93038 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNFRSF25Q93038 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNFRSF25Q93038 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TNFRSF25Q93038 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNFRSF25Q93038 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TNFRSF25Q93038 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TNFRSF25Q93038 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TNFRSF25Q93038 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TNFRSF25Q93038 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNFRSF25Q93038 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNFRSF25Q93038 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNFRSF25Q93038 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNFRSF25Q93038 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNFRSF25Q93038 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNFRSF25Q93038 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms