Protein–RNA interactions for Protein: Q92968

PEX13, Peroxisomal membrane protein PEX13, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX13Q92968 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PEX13Q92968 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PEX13Q92968 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PEX13Q92968 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PEX13Q92968 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PEX13Q92968 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PEX13Q92968 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PEX13Q92968 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PEX13Q92968 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PEX13Q92968 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PEX13Q92968 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PEX13Q92968 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PEX13Q92968 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PEX13Q92968 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PEX13Q92968 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PEX13Q92968 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PEX13Q92968 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PEX13Q92968 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PEX13Q92968 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PEX13Q92968 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PEX13Q92968 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PEX13Q92968 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PEX13Q92968 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PEX13Q92968 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PEX13Q92968 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PEX13Q92968 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PEX13Q92968 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PEX13Q92968 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PEX13Q92968 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PEX13Q92968 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PEX13Q92968 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PEX13Q92968 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PEX13Q92968 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PEX13Q92968 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PEX13Q92968 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PEX13Q92968 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PEX13Q92968 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PEX13Q92968 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PEX13Q92968 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PEX13Q92968 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PEX13Q92968 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PEX13Q92968 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PEX13Q92968 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PEX13Q92968 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PEX13Q92968 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PEX13Q92968 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PEX13Q92968 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PEX13Q92968 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PEX13Q92968 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PEX13Q92968 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PEX13Q92968 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PEX13Q92968 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PEX13Q92968 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PEX13Q92968 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PEX13Q92968 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PEX13Q92968 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PEX13Q92968 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PEX13Q92968 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PEX13Q92968 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PEX13Q92968 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PEX13Q92968 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PEX13Q92968 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PEX13Q92968 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PEX13Q92968 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PEX13Q92968 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PEX13Q92968 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PEX13Q92968 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PEX13Q92968 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PEX13Q92968 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PEX13Q92968 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PEX13Q92968 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PEX13Q92968 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PEX13Q92968 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PEX13Q92968 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PEX13Q92968 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PEX13Q92968 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PEX13Q92968 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PEX13Q92968 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PEX13Q92968 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PEX13Q92968 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PEX13Q92968 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PEX13Q92968 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PEX13Q92968 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PEX13Q92968 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PEX13Q92968 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PEX13Q92968 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PEX13Q92968 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PEX13Q92968 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PEX13Q92968 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PEX13Q92968 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PEX13Q92968 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PEX13Q92968 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PEX13Q92968 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PEX13Q92968 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PEX13Q92968 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PEX13Q92968 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PEX13Q92968 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PEX13Q92968 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PEX13Q92968 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PEX13Q92968 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms