Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
TNRQ92752 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
TNRQ92752 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
TNRQ92752 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.26
TNRQ92752 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC35.38■■■■□ 3.26
TNRQ92752 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.26
TNRQ92752 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
TNRQ92752 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
TNRQ92752 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
TNRQ92752 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
TNRQ92752 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
TNRQ92752 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
TNRQ92752 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
TNRQ92752 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
TNRQ92752 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
TNRQ92752 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
TNRQ92752 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
TNRQ92752 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
TNRQ92752 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
TNRQ92752 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
TNRQ92752 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
TNRQ92752 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
TNRQ92752 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
TNRQ92752 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC35.34■■■■□ 3.25
TNRQ92752 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
TNRQ92752 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC35.33■■■■□ 3.25
TNRQ92752 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
TNRQ92752 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC35.33■■■■□ 3.25
TNRQ92752 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
TNRQ92752 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
TNRQ92752 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC35.32■■■■□ 3.24
TNRQ92752 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
TNRQ92752 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
TNRQ92752 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
TNRQ92752 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
TNRQ92752 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
TNRQ92752 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
TNRQ92752 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
TNRQ92752 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
TNRQ92752 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
TNRQ92752 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
TNRQ92752 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
TNRQ92752 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
TNRQ92752 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
TNRQ92752 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
TNRQ92752 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
TNRQ92752 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
TNRQ92752 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
TNRQ92752 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
TNRQ92752 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
TNRQ92752 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
TNRQ92752 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
TNRQ92752 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
TNRQ92752 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC35.28■■■■□ 3.24
TNRQ92752 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
TNRQ92752 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
TNRQ92752 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
TNRQ92752 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
TNRQ92752 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
TNRQ92752 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
TNRQ92752 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
TNRQ92752 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
TNRQ92752 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
TNRQ92752 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
TNRQ92752 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
TNRQ92752 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
TNRQ92752 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
TNRQ92752 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
TNRQ92752 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
TNRQ92752 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
TNRQ92752 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
TNRQ92752 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
TNRQ92752 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
TNRQ92752 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
TNRQ92752 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
TNRQ92752 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
TNRQ92752 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
TNRQ92752 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
TNRQ92752 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
TNRQ92752 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
TNRQ92752 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
TNRQ92752 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
TNRQ92752 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
TNRQ92752 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
TNRQ92752 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
TNRQ92752 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
TNRQ92752 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
TNRQ92752 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
TNRQ92752 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
TNRQ92752 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
TNRQ92752 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TNRQ92752 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TNRQ92752 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
TNRQ92752 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TNRQ92752 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TNRQ92752 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TNRQ92752 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TNRQ92752 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
TNRQ92752 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
TNRQ92752 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms