Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GTF3AQ92664 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GTF3AQ92664 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GTF3AQ92664 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GTF3AQ92664 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GTF3AQ92664 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GTF3AQ92664 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF3AQ92664 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF3AQ92664 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF3AQ92664 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF3AQ92664 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF3AQ92664 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF3AQ92664 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF3AQ92664 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF3AQ92664 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF3AQ92664 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF3AQ92664 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF3AQ92664 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF3AQ92664 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GTF3AQ92664 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GTF3AQ92664 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
GTF3AQ92664 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GTF3AQ92664 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GTF3AQ92664 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GTF3AQ92664 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GTF3AQ92664 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GTF3AQ92664 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GTF3AQ92664 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GTF3AQ92664 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GTF3AQ92664 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GTF3AQ92664 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GTF3AQ92664 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GTF3AQ92664 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GTF3AQ92664 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GTF3AQ92664 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
GTF3AQ92664 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GTF3AQ92664 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GTF3AQ92664 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
GTF3AQ92664 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
GTF3AQ92664 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GTF3AQ92664 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GTF3AQ92664 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GTF3AQ92664 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GTF3AQ92664 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GTF3AQ92664 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GTF3AQ92664 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GTF3AQ92664 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GTF3AQ92664 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF3AQ92664 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF3AQ92664 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF3AQ92664 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF3AQ92664 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF3AQ92664 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF3AQ92664 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF3AQ92664 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF3AQ92664 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF3AQ92664 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF3AQ92664 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF3AQ92664 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF3AQ92664 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF3AQ92664 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF3AQ92664 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF3AQ92664 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF3AQ92664 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF3AQ92664 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF3AQ92664 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF3AQ92664 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF3AQ92664 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF3AQ92664 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF3AQ92664 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF3AQ92664 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF3AQ92664 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF3AQ92664 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF3AQ92664 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF3AQ92664 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF3AQ92664 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF3AQ92664 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF3AQ92664 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF3AQ92664 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF3AQ92664 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF3AQ92664 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF3AQ92664 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF3AQ92664 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF3AQ92664 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF3AQ92664 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF3AQ92664 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF3AQ92664 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF3AQ92664 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF3AQ92664 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF3AQ92664 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF3AQ92664 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF3AQ92664 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF3AQ92664 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF3AQ92664 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF3AQ92664 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF3AQ92664 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF3AQ92664 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF3AQ92664 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF3AQ92664 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF3AQ92664 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.2 ms