Protein–RNA interactions for Protein: Q92544

TM9SF4, Transmembrane 9 superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF4Q92544 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TM9SF4Q92544 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TM9SF4Q92544 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TM9SF4Q92544 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TM9SF4Q92544 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TM9SF4Q92544 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TM9SF4Q92544 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TM9SF4Q92544 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TM9SF4Q92544 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TM9SF4Q92544 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TM9SF4Q92544 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TM9SF4Q92544 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TM9SF4Q92544 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TM9SF4Q92544 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TM9SF4Q92544 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TM9SF4Q92544 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TM9SF4Q92544 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TM9SF4Q92544 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TM9SF4Q92544 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TM9SF4Q92544 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TM9SF4Q92544 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TM9SF4Q92544 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TM9SF4Q92544 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TM9SF4Q92544 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TM9SF4Q92544 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TM9SF4Q92544 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TM9SF4Q92544 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TM9SF4Q92544 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TM9SF4Q92544 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TM9SF4Q92544 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TM9SF4Q92544 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TM9SF4Q92544 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TM9SF4Q92544 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TM9SF4Q92544 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TM9SF4Q92544 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TM9SF4Q92544 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TM9SF4Q92544 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TM9SF4Q92544 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TM9SF4Q92544 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TM9SF4Q92544 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TM9SF4Q92544 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TM9SF4Q92544 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TM9SF4Q92544 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TM9SF4Q92544 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TM9SF4Q92544 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TM9SF4Q92544 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TM9SF4Q92544 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TM9SF4Q92544 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TM9SF4Q92544 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TM9SF4Q92544 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM9SF4Q92544 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM9SF4Q92544 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM9SF4Q92544 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM9SF4Q92544 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM9SF4Q92544 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM9SF4Q92544 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM9SF4Q92544 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM9SF4Q92544 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TM9SF4Q92544 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TM9SF4Q92544 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TM9SF4Q92544 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TM9SF4Q92544 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TM9SF4Q92544 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TM9SF4Q92544 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TM9SF4Q92544 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TM9SF4Q92544 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TM9SF4Q92544 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TM9SF4Q92544 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TM9SF4Q92544 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TM9SF4Q92544 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TM9SF4Q92544 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TM9SF4Q92544 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM9SF4Q92544 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM9SF4Q92544 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM9SF4Q92544 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM9SF4Q92544 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM9SF4Q92544 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM9SF4Q92544 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM9SF4Q92544 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM9SF4Q92544 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM9SF4Q92544 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM9SF4Q92544 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM9SF4Q92544 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM9SF4Q92544 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM9SF4Q92544 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM9SF4Q92544 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TM9SF4Q92544 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM9SF4Q92544 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM9SF4Q92544 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TM9SF4Q92544 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TM9SF4Q92544 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TM9SF4Q92544 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TM9SF4Q92544 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TM9SF4Q92544 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TM9SF4Q92544 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TM9SF4Q92544 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TM9SF4Q92544 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM9SF4Q92544 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM9SF4Q92544 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM9SF4Q92544 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms