Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
DNAAF4Q8WXU2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
DNAAF4Q8WXU2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
DNAAF4Q8WXU2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
DNAAF4Q8WXU2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
DNAAF4Q8WXU2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
DNAAF4Q8WXU2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
DNAAF4Q8WXU2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
DNAAF4Q8WXU2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
DNAAF4Q8WXU2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
DNAAF4Q8WXU2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
DNAAF4Q8WXU2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
DNAAF4Q8WXU2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
DNAAF4Q8WXU2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
DNAAF4Q8WXU2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
DNAAF4Q8WXU2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
DNAAF4Q8WXU2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
DNAAF4Q8WXU2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
DNAAF4Q8WXU2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
DNAAF4Q8WXU2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
DNAAF4Q8WXU2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
DNAAF4Q8WXU2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
DNAAF4Q8WXU2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
DNAAF4Q8WXU2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
DNAAF4Q8WXU2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
DNAAF4Q8WXU2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
DNAAF4Q8WXU2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
DNAAF4Q8WXU2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
DNAAF4Q8WXU2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
DNAAF4Q8WXU2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
DNAAF4Q8WXU2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
DNAAF4Q8WXU2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
DNAAF4Q8WXU2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
DNAAF4Q8WXU2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
DNAAF4Q8WXU2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
DNAAF4Q8WXU2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
DNAAF4Q8WXU2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
DNAAF4Q8WXU2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
DNAAF4Q8WXU2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
DNAAF4Q8WXU2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
DNAAF4Q8WXU2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
DNAAF4Q8WXU2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
DNAAF4Q8WXU2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
DNAAF4Q8WXU2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
DNAAF4Q8WXU2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
DNAAF4Q8WXU2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
DNAAF4Q8WXU2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
DNAAF4Q8WXU2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
DNAAF4Q8WXU2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
DNAAF4Q8WXU2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
DNAAF4Q8WXU2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
DNAAF4Q8WXU2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
DNAAF4Q8WXU2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
DNAAF4Q8WXU2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
DNAAF4Q8WXU2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
DNAAF4Q8WXU2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
DNAAF4Q8WXU2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
DNAAF4Q8WXU2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
DNAAF4Q8WXU2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
DNAAF4Q8WXU2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
DNAAF4Q8WXU2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
DNAAF4Q8WXU2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
DNAAF4Q8WXU2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
DNAAF4Q8WXU2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
DNAAF4Q8WXU2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
DNAAF4Q8WXU2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
DNAAF4Q8WXU2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
DNAAF4Q8WXU2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
DNAAF4Q8WXU2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
DNAAF4Q8WXU2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
DNAAF4Q8WXU2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
DNAAF4Q8WXU2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
DNAAF4Q8WXU2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
DNAAF4Q8WXU2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
DNAAF4Q8WXU2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
DNAAF4Q8WXU2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
DNAAF4Q8WXU2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
DNAAF4Q8WXU2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
DNAAF4Q8WXU2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
DNAAF4Q8WXU2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
DNAAF4Q8WXU2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
DNAAF4Q8WXU2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
DNAAF4Q8WXU2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
DNAAF4Q8WXU2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
DNAAF4Q8WXU2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
DNAAF4Q8WXU2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
DNAAF4Q8WXU2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
DNAAF4Q8WXU2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
DNAAF4Q8WXU2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
DNAAF4Q8WXU2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
DNAAF4Q8WXU2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
DNAAF4Q8WXU2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
DNAAF4Q8WXU2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
DNAAF4Q8WXU2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
DNAAF4Q8WXU2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
DNAAF4Q8WXU2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
DNAAF4Q8WXU2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
DNAAF4Q8WXU2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
DNAAF4Q8WXU2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
DNAAF4Q8WXU2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms