Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC3

PYDC1, Pyrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYDC1Q8WXC3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PYDC1Q8WXC3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PYDC1Q8WXC3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PYDC1Q8WXC3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PYDC1Q8WXC3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PYDC1Q8WXC3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PYDC1Q8WXC3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PYDC1Q8WXC3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PYDC1Q8WXC3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PYDC1Q8WXC3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PYDC1Q8WXC3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PYDC1Q8WXC3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PYDC1Q8WXC3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PYDC1Q8WXC3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PYDC1Q8WXC3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PYDC1Q8WXC3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PYDC1Q8WXC3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PYDC1Q8WXC3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PYDC1Q8WXC3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PYDC1Q8WXC3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PYDC1Q8WXC3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PYDC1Q8WXC3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PYDC1Q8WXC3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PYDC1Q8WXC3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PYDC1Q8WXC3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PYDC1Q8WXC3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PYDC1Q8WXC3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PYDC1Q8WXC3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PYDC1Q8WXC3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PYDC1Q8WXC3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PYDC1Q8WXC3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PYDC1Q8WXC3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PYDC1Q8WXC3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PYDC1Q8WXC3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PYDC1Q8WXC3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PYDC1Q8WXC3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PYDC1Q8WXC3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PYDC1Q8WXC3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PYDC1Q8WXC3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PYDC1Q8WXC3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PYDC1Q8WXC3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PYDC1Q8WXC3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PYDC1Q8WXC3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PYDC1Q8WXC3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PYDC1Q8WXC3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PYDC1Q8WXC3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PYDC1Q8WXC3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PYDC1Q8WXC3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PYDC1Q8WXC3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PYDC1Q8WXC3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PYDC1Q8WXC3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PYDC1Q8WXC3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PYDC1Q8WXC3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PYDC1Q8WXC3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PYDC1Q8WXC3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PYDC1Q8WXC3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PYDC1Q8WXC3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PYDC1Q8WXC3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PYDC1Q8WXC3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PYDC1Q8WXC3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PYDC1Q8WXC3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PYDC1Q8WXC3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PYDC1Q8WXC3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PYDC1Q8WXC3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PYDC1Q8WXC3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PYDC1Q8WXC3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PYDC1Q8WXC3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PYDC1Q8WXC3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PYDC1Q8WXC3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PYDC1Q8WXC3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PYDC1Q8WXC3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PYDC1Q8WXC3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PYDC1Q8WXC3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PYDC1Q8WXC3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PYDC1Q8WXC3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PYDC1Q8WXC3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PYDC1Q8WXC3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PYDC1Q8WXC3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PYDC1Q8WXC3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PYDC1Q8WXC3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PYDC1Q8WXC3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PYDC1Q8WXC3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PYDC1Q8WXC3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PYDC1Q8WXC3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PYDC1Q8WXC3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PYDC1Q8WXC3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PYDC1Q8WXC3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PYDC1Q8WXC3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PYDC1Q8WXC3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PYDC1Q8WXC3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PYDC1Q8WXC3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PYDC1Q8WXC3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PYDC1Q8WXC3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PYDC1Q8WXC3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PYDC1Q8WXC3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PYDC1Q8WXC3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PYDC1Q8WXC3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PYDC1Q8WXC3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PYDC1Q8WXC3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PYDC1Q8WXC3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1198.3 ms