Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVY7

UBLCP1, Ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBLCP1Q8WVY7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBLCP1Q8WVY7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBLCP1Q8WVY7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBLCP1Q8WVY7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBLCP1Q8WVY7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBLCP1Q8WVY7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBLCP1Q8WVY7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBLCP1Q8WVY7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBLCP1Q8WVY7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBLCP1Q8WVY7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBLCP1Q8WVY7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBLCP1Q8WVY7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBLCP1Q8WVY7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBLCP1Q8WVY7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBLCP1Q8WVY7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBLCP1Q8WVY7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBLCP1Q8WVY7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBLCP1Q8WVY7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBLCP1Q8WVY7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBLCP1Q8WVY7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBLCP1Q8WVY7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBLCP1Q8WVY7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBLCP1Q8WVY7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBLCP1Q8WVY7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBLCP1Q8WVY7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
UBLCP1Q8WVY7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBLCP1Q8WVY7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBLCP1Q8WVY7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBLCP1Q8WVY7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBLCP1Q8WVY7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBLCP1Q8WVY7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBLCP1Q8WVY7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBLCP1Q8WVY7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBLCP1Q8WVY7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBLCP1Q8WVY7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBLCP1Q8WVY7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
UBLCP1Q8WVY7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
UBLCP1Q8WVY7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBLCP1Q8WVY7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBLCP1Q8WVY7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBLCP1Q8WVY7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBLCP1Q8WVY7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBLCP1Q8WVY7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBLCP1Q8WVY7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBLCP1Q8WVY7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBLCP1Q8WVY7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBLCP1Q8WVY7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBLCP1Q8WVY7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBLCP1Q8WVY7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBLCP1Q8WVY7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBLCP1Q8WVY7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBLCP1Q8WVY7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBLCP1Q8WVY7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBLCP1Q8WVY7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBLCP1Q8WVY7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBLCP1Q8WVY7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBLCP1Q8WVY7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBLCP1Q8WVY7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBLCP1Q8WVY7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
UBLCP1Q8WVY7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBLCP1Q8WVY7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBLCP1Q8WVY7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBLCP1Q8WVY7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
UBLCP1Q8WVY7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBLCP1Q8WVY7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBLCP1Q8WVY7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBLCP1Q8WVY7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBLCP1Q8WVY7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBLCP1Q8WVY7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBLCP1Q8WVY7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBLCP1Q8WVY7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBLCP1Q8WVY7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBLCP1Q8WVY7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBLCP1Q8WVY7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBLCP1Q8WVY7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBLCP1Q8WVY7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBLCP1Q8WVY7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBLCP1Q8WVY7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBLCP1Q8WVY7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBLCP1Q8WVY7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBLCP1Q8WVY7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBLCP1Q8WVY7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBLCP1Q8WVY7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBLCP1Q8WVY7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBLCP1Q8WVY7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBLCP1Q8WVY7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBLCP1Q8WVY7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBLCP1Q8WVY7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBLCP1Q8WVY7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBLCP1Q8WVY7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBLCP1Q8WVY7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBLCP1Q8WVY7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBLCP1Q8WVY7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
UBLCP1Q8WVY7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBLCP1Q8WVY7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBLCP1Q8WVY7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBLCP1Q8WVY7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBLCP1Q8WVY7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBLCP1Q8WVY7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBLCP1Q8WVY7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 555.7 ms