Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUW1

BRK1, Protein BRICK1, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRK1Q8WUW1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BRK1Q8WUW1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BRK1Q8WUW1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BRK1Q8WUW1 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BRK1Q8WUW1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BRK1Q8WUW1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BRK1Q8WUW1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BRK1Q8WUW1 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BRK1Q8WUW1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BRK1Q8WUW1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BRK1Q8WUW1 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BRK1Q8WUW1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BRK1Q8WUW1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BRK1Q8WUW1 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BRK1Q8WUW1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BRK1Q8WUW1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BRK1Q8WUW1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BRK1Q8WUW1 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BRK1Q8WUW1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BRK1Q8WUW1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BRK1Q8WUW1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BRK1Q8WUW1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BRK1Q8WUW1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BRK1Q8WUW1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BRK1Q8WUW1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BRK1Q8WUW1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BRK1Q8WUW1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BRK1Q8WUW1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BRK1Q8WUW1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BRK1Q8WUW1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BRK1Q8WUW1 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BRK1Q8WUW1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BRK1Q8WUW1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BRK1Q8WUW1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BRK1Q8WUW1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BRK1Q8WUW1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BRK1Q8WUW1 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BRK1Q8WUW1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BRK1Q8WUW1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BRK1Q8WUW1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BRK1Q8WUW1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BRK1Q8WUW1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BRK1Q8WUW1 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BRK1Q8WUW1 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BRK1Q8WUW1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BRK1Q8WUW1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
BRK1Q8WUW1 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
BRK1Q8WUW1 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
BRK1Q8WUW1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
BRK1Q8WUW1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
BRK1Q8WUW1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BRK1Q8WUW1 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BRK1Q8WUW1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BRK1Q8WUW1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BRK1Q8WUW1 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BRK1Q8WUW1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BRK1Q8WUW1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BRK1Q8WUW1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BRK1Q8WUW1 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BRK1Q8WUW1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
BRK1Q8WUW1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
BRK1Q8WUW1 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BRK1Q8WUW1 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BRK1Q8WUW1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
BRK1Q8WUW1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
BRK1Q8WUW1 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BRK1Q8WUW1 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BRK1Q8WUW1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BRK1Q8WUW1 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BRK1Q8WUW1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BRK1Q8WUW1 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
BRK1Q8WUW1 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
BRK1Q8WUW1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BRK1Q8WUW1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
BRK1Q8WUW1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BRK1Q8WUW1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BRK1Q8WUW1 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
BRK1Q8WUW1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
BRK1Q8WUW1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
BRK1Q8WUW1 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BRK1Q8WUW1 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
BRK1Q8WUW1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BRK1Q8WUW1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
BRK1Q8WUW1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BRK1Q8WUW1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
BRK1Q8WUW1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
BRK1Q8WUW1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BRK1Q8WUW1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BRK1Q8WUW1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BRK1Q8WUW1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
BRK1Q8WUW1 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
BRK1Q8WUW1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BRK1Q8WUW1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BRK1Q8WUW1 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BRK1Q8WUW1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
BRK1Q8WUW1 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BRK1Q8WUW1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BRK1Q8WUW1 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
BRK1Q8WUW1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
BRK1Q8WUW1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms